Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   
2  
 5'  3'   
3  
 5'  3'   
4  
 5'  3'   
5  
 5'  3'   
6  
 5'  3'   
7  
 5'  3'   
8  
 5'  3'   
9  
 5'  3'   
10  
 5'  3'   
11  
 5'  3'   
12  
 5'  3'   
13  
 5'  3'   
14  
 5'  3'   
15  
 5'  3'   
16  
 5'  3'   
17  
 5'  3'   
18  
 5'  3'   
19  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTGCTGAGTGGTGGGTTCAGCAATTTGGAAAGTCTTTGCCATTCTTAAATTGGCTTCCTTATCTTGGGGgtaagatgtcttcgttatctagtattctttctgttttggaccaaaaggtttatatgtcaatattgctatttgtggtaattatcttacctgttccaagttt...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA12G08720.1
intron # 10
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|58021674|gb|CX708415.1|CX708415
EST:     CAATTTGAAAAGTCTTTGCCATTCTTAAATT-GCTTTCCTTATCTTGGGG                         GAATCCCGACATTCAAAGCTATATTGTGTTTAATGATAGCTTTTGGTGTTA
genomic: CAATTTGGAAAGTCTTTGCCATTCTTAAATTGGC-TTCCTTATCTTGGGGgtaagatgtc ... tgaatttcagGAATCCCGACATTCAAAGCTATATTGTGTTTAATGATAGCTTTTGGTGTTA
EST: gi|16996551|gb|BM085923.1|BM085923
EST:     GCAATTTGGAAAGTCTTTGCCATTCTTAAATTGGCTTCCTTATCTTGGGG                         GAATCCCGACATTCAAAGCTATATTGTGTTTAATGATAGCTTTTGGTGTTA
genomic: GCAATTTGGAAAGTCTTTGCCATTCTTAAATTGGCTTCCTTATCTTGGGGgtaagatgtc ... tgaatttcagGAATCCCGACATTCAAAGCTATATTGTGTTTAATGATAGCTTTTGGTGTTA
EST: gi|58023371|gb|CX710112.1|CX710112
EST:     CTTAAATTGGCTTCCTTATCTTGGGG                         GAATCCCGACATTCAAAGCTATATTGTGTTTAATGATAGCTTTTGGTGTTA
genomic: CTTAAATTGGCTTCCTTATCTTGGGGgtaagatgtc ... tgaatttcagGAATCCCGACATTCAAAGCTATATTGTGTTTAATGATAGCTTTTGGTGTTA