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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GGTTGTTTGGATTACTGGTGCTAGCCGTGGAATTggtataacaacaactctaccatttttttatattttttttatatcactcttctaaatctatagggttgattcattcattcatgttaacattggacttacat...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA18G47960.1
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|6726744|gb|AW311098.1|AW311098
EST:     GGTTGTTTGGATTACTGGTGCTAGCCGTGGAATT                         GGGGAGATTCTGGCTAAACAGTTTGCAAGTTTAGGGGCCAAGCTTATTATC
genomic: GGTTGTTTGGATTACTGGTGCTAGCCGTGGAATTggtataacaa ... attgtatgaaGGGGAGATTCTGGCTAAACAGTTTGCAAGTTTAGGGGCCAAGCTTATTATC
EST: gi|298188014|gb|HO031971.1|HO031971
EST:     GGTTGTTTGGATTACTGGTGCTAGCCGTGGAATT                         GGGGAGATTCTGGCTAAACAGTTTGCAAGTTTAGGGGCCAAGCTTATTATC
genomic: GGTTGTTTGGATTACTGGTGCTAGCCGTGGAATTggtataacaa ... attgtatgaaGGGGAGATTCTGGCTAAACAGTTTGCAAGTTTAGGGGCCAAGCTTATTATC
EST: gi|192305183|gb|FG993949.1|FG993949
EST:     GGTTGTTTGGATTACTGGTGCTAGCCGTGGAATT                         GGGGAGATTCTGGCTAAACAGTTTGCAAGTTTAGGGGCCAAGCTTATTATC
genomic: GGTTGTTTGGATTACTGGTGCTAGCCGTGGAATTggtataacaa ... attgtatgaaGGGGAGATTCTGGCTAAACAGTTTGCAAGTTTAGGGGCCAAGCTTATTATC
EST: gi|16347967|gb|BI973562.1|BI973562
EST:     GGTTGTTTGGATTACTGGTGCTAGCCGTGGAATT                         GGGGAGATTCTGGCTAAACAGTTTGCAAGTTTAGGGGCCAAGCTTATTATC
genomic: GGTTGTTTGGATTACTGGTGCTAGCCGTGGAATTggtataacaa ... attgtatgaaGGGGAGATTCTGGCTAAACAGTTTGCAAGTTTAGGGGCCAAGCTTATTATC
EST: gi|10845691|gb|BF071167.1|BF071167
EST:     GGTTGTTTGGATTACTGGTGCTAGCCGTGGAATT                         GGGGAGATTCTGGCTAAACAGTTTGCAAGTTTAGGGGCCAAGCTTATTATC
genomic: GGTTGTTTGGATTACTGGTGCTAGCCGTGGAATTggtataacaa ... attgtatgaaGGGGAGATTCTGGCTAAACAGTTTGCAAGTTTAGGGGCCAAGCTTATTATC
EST: gi|18848709|gb|BM567821.1|BM567821
EST:     GGTTGTTTGGATTACTGGTGCTAGCCGTGGAATT                         GGGGAGATTCTGGCTAAACAGTTTGCAAGTTTAGGGGCCAAGCTTATTATC
genomic: GGTTGTTTGGATTACTGGTGCTAGCCGTGGAATTggtataacaa ... attgtatgaaGGGGAGATTCTGGCTAAACAGTTTGCAAGTTTAGGGGCCAAGCTTATTATC
EST: gi|254342710|gb|GR858872.1|GR858872
EST:     GGTTGTTTGGATTACTGGTGCTAGCCGTGGAATT                         GGGGAGATTCTGGCTAAACAGTTTGCAAGTTTAGGGGCCAAGCTTATTATC
genomic: GGTTGTTTGGATTACTGGTGCTAGCCGTGGAATTggtataacaa ... attgtatgaaGGGGAGATTCTGGCTAAACAGTTTGCAAGTTTAGGGGCCAAGCTTATTATC
EST: gi|209725122|gb|BW663062.1|BW663062
EST:     GGTTGTTTGGATTACTGGTGCTAGCCGTGGAATT                         GGGGAGATTCTGGCTAAACAGTTTGCAAGTTTAGGGGCCAAGCTTATTATC
genomic: GGTTGTTTGGATTACTGGTGCTAGCCGTGGAATTggtataacaa ... attgtatgaaGGGGAGATTCTGGCTAAACAGTTTGCAAGTTTAGGGGCCAAGCTTATTATC
EST: gi|6724680|gb|AW309013.1|AW309013
EST:     GGTTGTTTGGATTACTGGTGCTAGCCGTGGAATT                         GGGGAGATTCTGGCTAAACAGTTTGCAAGTTTAGGGGCCAAGCTTATTATC
genomic: GGTTGTTTGGATTACTGGTGCTAGCCGTGGAATTggtataacaa ... attgtatgaaGGGGAGATTCTGGCTAAACAGTTTGCAAGTTTAGGGGCCAAGCTTATTATC