1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
gtacttagcttagttatcgagcagaggtctatgatttccattagatcttccttgtattgggtctcaatgattttgatggtttgcacatcaaatcatccaaagtccaatccattttttgtgatcatatagGCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCTTTCCGAGTTCCTACTGTGGATGTTTCAGTCGTGGACCTTACTGTTAGGC
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv01s0010g02460.t01 |
intron # | 8 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAG GCTGTTGGAAAGGTGCTGCCCGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCTEST: gi|161720959|gb|FC070345.1|FC070345
genomic: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAGgtacttagct ... gatcatatagGCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCT
EST: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAG GCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCTEST: gi|110703819|gb|EE080998.1|EE080998
genomic: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAGgtacttagct ... gatcatatagGCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCT
EST: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAG GCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCTEST: gi|30134772|gb|CB920110.1|CB920110
genomic: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAGgtacttagct ... gatcatatagGCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCT
EST: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAG GCTGTTGGAAAGGTGCTGCCCGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCTEST: gi|110701389|gb|EE078905.1|EE078905
genomic: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAGgtacttagct ... gatcatatagGCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCT
EST: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAA GCTGTTGGAAAAGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAAC-GGCATGTCTEST: gi|110384047|gb|EC948461.1|EC948461
genomic: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAGgtacttagct ... gatcatatagGCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCT
EST: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAG GCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCTEST: gi|110697161|gb|EE073909.1|EE073909
genomic: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAGgtacttagct ... gatcatatagGCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCT
EST: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAA GCTGTTGGAAAAGTGCTGCCTGCACTGAATGGGGAGTTTACCCGGCATGTCEST: gi|161716699|gb|FC065571.1|FC065571
genomic: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAGgtacttagct ... gatcatatagGCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACC-GGCATGTC
EST: GAAGAGCTGCTTCCTTCA-CATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCA-G GCTGTTGGAA-GGTGCTGCC-GCACTGEST: gi|110363529|gb|EC927123.1|EC927123
genomic: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAGgtacttagct ... gatcatatagGCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTG
EST: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAG GCTGTTGGAAAGGTGCTGCCCGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCTEST: gi|30134770|gb|CB920108.1|CB920108
genomic: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAGgtacttagct ... gatcatatagGCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCT
EST: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAG GCTGTTGGAAAGGTGCTGCCCGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCTEST: gi|110687944|gb|EE065928.1|EE065928
genomic: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAGgtacttagct ... gatcatatagGCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCT
EST: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGTCAAG GCTGTTGGAAAGGTGCTGCCCGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCTEST: gi|110373445|gb|EC937683.1|EC937683
genomic: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAGgtacttagct ... gatcatatagGCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCT
EST: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAG GCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCTEST: gi|110707375|gb|EE083731.1|EE083731
genomic: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAGgtacttagct ... gatcatatagGCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCT
EST: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAG GCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGT-AACCGGCATGTCNEST: gi|161718038|gb|FC067580.1|FC067580
genomic: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAGgtacttagct ... gatcatatagGCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCT
EST: GAAGAGCTGCTTCCTTCA-CATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCA-G GCTGTTGGAA-GGTGCTGC-TGCACTGAEST: gi|110707438|gb|EE083837.1|EE083837
genomic: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAGgtacttagct ... gatcatatagGCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGA
EST: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAG GCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCTEST: gi|71856620|gb|DT005675.1|DT005675
genomic: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAGgtacttagct ... gatcatatagGCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCT
EST: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAG GCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCTEST: gi|161715330|gb|FC065818.1|FC065818
genomic: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAGgtacttagct ... gatcatatagGCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCT
EST: GAAGAGCTGCTTCCTTCA-CATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGT-AACCGGCATEST: gi|110688396|gb|EE066900.1|EE066900
genomic: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAGgtacttagct ... gatcatatagGCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCAT
EST: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAACACTGGTGCTGCCAAG GCTGTTTGGAA-GGTGCTGCCCGCACTGAATGGGAAGT-AACCGGGC-TGTEST: gi|110371235|gb|EC935092.1|EC935092
genomic: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAGgtacttagct ... gatcatatagGCTGTT-GGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGG-CATGT
EST: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAG GCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCT
genomic: GAAGAGCTGCTTCCTTCAACATCATCCCCAGCAGCACTGGTGCTGCCAAGgtacttagct ... gatcatatagGCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCT
gatggtttgcacatcaaatcatccaaagtccaatccattttttgtgatcatatagGCTGTTGGAAAGGTGCTGCCTGCACTGAATGGGAAGTTAACCGGCATGTCTTTCCGAGTTCCTACTGTGGATGTTTCAGTCGTGGACCTTACTGTTAGGC
ttttgat putative branch site (score: 4)
attttttgt TA-rich tract