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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaagtgggacacacttcaagtgacacacctccaaagacctcctgctctaccttgggtccagatgttgtatttgacaatccccgcagGCCCGCACCGCCGCCTCCACGACCTCCCCCACCGCCGTTGCCGCCTAA

Basic information

species Chlamydomonas reinhardtii
transcript EDO98189
intron # 45
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

caaagacctcctgctctaccttgggtccagatgttgtatttgacaatccccgcagGCCCGCACCGCCGCCTCCACGACCTCCCCCACCGCCGTTGCCGCCTAA
                                     atttgac  putative branch site (score: 4)
 tccccgc  putative PPT
 ttgtattt  TA-rich tract