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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtgagtgtccagacgagctgctgccggtttgcgtgctccgcatcacgcttgcatccgctctcatgtcgtgcgatcgccgcctgacgccgcccttcccttcccaccctgccctgccccccccacctcagGCGCCCATCCGCCTCAACTTTGCCATGGGCCCGCTGCCCACCACCGTGCGCCGCCTGCTCTTCGCCAACGGGCCGGGCGCCGCCGGCTCCAGCCTGCCGC

Basic information

species Chlamydomonas reinhardtii
transcript EDO98189
intron # 160
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tcgccgcctgacgccgcccttcccttcccaccctgccctgccccccccacctcagGCGCCCATCCGCCTCAACTTTGCCATGGGCCCGCTGCCCACCACCGTGCGCCGCCTGCTCTTCGCCAACGGGCCGGGCGCCGCCGGCTCCAGCCTGCCGC
     gcctgac  putative branch site (score: 3)
 ccgcccttcccttccc  CT-rich tract