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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtggggtgggcgcgcgtggcggcaacggctgggaattgtgtggacgaagtgttttgacgactggctgcgtgcctactccatggctgccccgccgtccgcatgtgcaaggggctaactcctgcctgcatactgctgcccttgccggtgcacagTACGTGGACGTGAAGGACCCCATCCCAGACCTCAACACGCAAGCCGTGTTTCAGTACCTGCTCATTACCAACCAG

Basic information

species Chlamydomonas reinhardtii
transcript EDO98189
intron # 126
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

gcatgtgcaaggggctaactcctgcctgcatactgctgcccttgccggtgcacagTACGTGGACGTGAAGGACCCCATCCCAGACCTCAACACGCAAGCCGTGTTTCAGTACCTGCTCATTACCAACCAG
            ggctaac  putative branch site (score: 2)
 cccttgcc  putative PPT