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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtgaggcgggtgcgaagctgtggaccggagggttacacagtctctattccagaggggagggtgactcattaatgagtccaggcgcatgcggctgcgggccacacggagggagtaggttgccgactttacaaagctcgcccggctacacacgcccgccttcccccgcagACACGGACGGCGAGGGCATCACGTGGTTTGAGCTGAGCACCATCTCGGCCCGCTGCAAATCGCTGGGCGAGGACTGCTTCCTGCTGGCGGCCGACGTCAA

Basic information

species Chlamydomonas reinhardtii
transcript EDO98189
intron # 21
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

aggttgccgactttacaaagctcgcccggctacacacgcccgccttcccccgcagACACGGACGGCGAGGGCATCACGTGGTTTGAGCTGAGCACCATCTCGGCCCGCTGCAAATCGCTGGGCGAGGACTGCTTCCTGCTGGCGGCCGACGTCAA
                                    cgcccgccttccccc  CT-rich tract
 tttacaaa  TA-rich tract