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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GATTCTGAAGAATAACCAATTGATAGGACCGATCCCTTCAACACTTTCACAGATTCCAAACCTGAAAATTCTgtatgttccccatgattcttacatgtcttactacttttagctatataggtgatcatacatgtgtaatttcaattgcag

Basic information

species Arabidopsis thaliana
transcript AT2G26330.1
intron # 6
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|164165246|gb|ES060399.1|ES060399
EST:     ATAGGACCGATCCCTTCAACACTTTCACAGATTCCAAACCTGAAAATTCT                         GGACTTGGCACAGAATA
genomic: ATAGGACCGATCCCTTCAACACTTTCACAGATTCCAAACCTGAAAATTCTgtatgttccc ... tcaattgcagGGACTTGGCACAGAATA
EST: gi|124712534|gb|EH803936.1|EH803936
EST:     ATAGGACCGATCCCTTCAACACTTTCACAGATTCCAAACCTGAAAATTCT                         GGACTTGGCACAGAATAAACTCAGTGGTGAGATACCAAGACTTATT
genomic: ATAGGACCGATCCCTTCAACACTTTCACAGATTCCAAACCTGAAAATTCTgtatgttccc ... tcaattgcagGGACTTGGCACAGAATAAACTCAGTGGTGAGATACCAAGACTTATT