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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TGTAACGGCACTTATGGAAAAGCTGGTTTATCCAAATCCTGGTGGTTACAGGGATCTGTTAGTTCGCTTTTCTTCCCTCAATCATAAAAGATATTATAAGgtgcagtggttagaaataacttagatagatattcccattataatttattttgatatttttcctaatgaattccatgcatcttaataaacacag

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM5G858094_T01
intron # 25
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM5G858094_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 25
lower sequence: LOC_Os05g22940.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 27
TGTAACGGCACTTATGGAAAAGCTGGTTTATCCAAATCCTGGTGGTTACAGGGATCTGTTAGTTCGCTTTTCTTCCCTCAATCATAAAAGATATTATAAGgtgcagtggttagaaataacttag-atagatattcccattataatttattttgatattttt-cctaatgaattccatgcatcttaataaacacag
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GATACTAAAACTCATGGAGAGTCTGGTCTATCCAAATCCTGCTGCCTACAGGGATCAATTGATTCGCTTTTCTTCCCTTAATCACAAAGCGTATTACAAGgtgaccaggataaacataaataaacgtgaatttttcaatgaccttttcttctgacatctgaatctgatgaatttcttgcatattaatacag----