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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GATTCGAAGAATTTTGGGTGGGAGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgtttaaatctctaccatgactgtgagcatgttctccgcaactgctgaccctgaaggaatatcatattgcccaaggtcctaattttttcttcttctcttcag

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM5G806449_T03
intron # 5
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM5G806449_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 4
lower sequence: LOC_Os02g56850.4 (Oryza sativa), 5'ss of exon 2
GATTCGAAGAATTTTGGGTGGGAGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgtttaaatctctaccatgactgtgagcatgttctc-cgcaactgctgaccctgaaggaatatcatattgcccaaggtcctaattttttcttcttctcttcag
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GATGCAAAGAATTTTGGGTGGGAAATCAATGGGGACATTAACTTCAACTGGAAAAGGCTGCTGGAAAATAAGgtca-----gagccgcaaccttggttgggagaacgttcctgcattattatttgctcgttataaatgct-tacaacccaatattgtaaaaaccg----ttctctgcag
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|211339791|gb|FK980807.1|FK980807
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGATATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|94477026|gb|EB705984.1|EB705984
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|91056622|gb|EB167040.1|EB167040
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|149099075|gb|EE185096.2|EE185096
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|71436532|gb|DR817582.1|DR817582
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|211341005|gb|FL266234.1|FL266234
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATC
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATC
EST: gi|44682235|gb|CK787283.1|CK787283
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGATATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
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EST: gi|31611942|gb|CD568564.1|CD568564
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
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EST: gi|148994377|gb|EE034060.2|EE034060
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|148943405|gb|EC888464.2|EC888464
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
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EST: gi|31664370|gb|CD573095.1|CD573095
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
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EST: gi|56382419|gb|CV985088.1|CV985088
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGATATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
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EST: gi|211426649|gb|FL071977.1|FL071977
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|149014256|gb|EE043820.2|EE043820
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|111991059|gb|EE331961.1|EE331961
EST:     ATTAACGGAGATATTAACTTCAAATTGGAAAACGATTTTGGGAAAATAAG                         G
genomic: ATTAACGGAGATATTAACTTCAA-TTGGAAAACGCTATTGG-AAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcag-
EST: gi|111991059|gb|EE331961.1|EE331961
EST:     ATTAACGGAGATATTAACTTCAAATTGGAAAACGATTTTGGGAAAATAAG                         G
genomic: ATTAACGGAGATATTAACTTCAA-TTGGAAAACGCTATTGG-AAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcag-
EST: gi|24934176|gb|CA452394.1|CA452394
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|31405875|gb|CD484607.1|CD484607
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|29577206|gb|CB617318.1|CB617318
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|30306583|gb|CD001256.1|CD001256
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCCTTACCAG
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCC-TTACCAG
EST: gi|24934507|gb|CA452725.1|CA452725
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|211426648|gb|FL071976.1|FL071976
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|148937231|gb|EC881413.2|EC881413
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|149084822|gb|EE174326.2|EE174326
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|149077608|gb|EE166308.2|EE166308
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|149074405|gb|EE162793.2|EE162793
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|28910264|gb|CB331352.1|CB331352
EST:     GATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: GATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTA-TTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|40485831|gb|CK394761.1|CK394761
EST:     ATTAACGGAAAATATTAACTTCAATTGGAAAACGATATTGGAAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCA
genomic: ATTAACGGAGA-TATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAA-TAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCA
EST: gi|76293305|gb|DV032873.1|DV032873
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|71311904|gb|DR792431.1|DR792431
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|149089937|gb|EE179225.2|EE179225
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|44682244|gb|CK787292.1|CK787292
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGATATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|149108741|gb|EE292941.2|EE292941
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|47962001|gb|CN844710.1|CN844710
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGATATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|32938226|gb|CF043045.1|CF043045
EST:     AGATTAACGGAGGTATTATTTTCAATTGGAAAACGATATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|31611973|gb|CD568595.1|CD568595
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|44681912|gb|CK786960.1|CK786960
EST:     GATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGGAAAACGATATTGGAAA-TAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCCAG
genomic: GATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGG-AAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACC-AG
EST: gi|76012767|gb|DT939937.1|DT939937
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|33942501|gb|CF349101.1|CF349101
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGATATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTA
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTA
EST: gi|44681887|gb|CK786935.1|CK786935
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGATATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|24934516|gb|CA452734.1|CA452734
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGT
EST: gi|211337400|gb|FK980798.1|FK980798
EST:     AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGATATTGGAAAATAAG                         ACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTG
genomic: AGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTG

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 4 RNA-Seq libraries.


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 531

GATTCGAAGAATTTTGGGTGGGAGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGTGCCGGTGTGACAATGATTGAAGGGGCAGGCAGTCTAGTTGATGCTCATA


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 3008

GATTCGAAGAATTTTGGGTGGGAGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGTGCCGGTGTGACAATGATTGAAGGGGCAGGCAGTCTAGTTGATGCTCATA


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 2140

GATTCGAAGAATTTTGGGTGGGAGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGTGCCGGTGTGACAATGATTGAAGGGGCAGGCAGTCTAGTTGATGCTCATA


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 723

GATTCGAAGAATTTTGGGTGGGAGATTAACGGAGATATTAACTTCAATTGGAAAACGCTATTGGAAAATAAGgtcatgttta ... ttctcttcagACTAAAGAAATTGTTAGATTAAATGGTGTGTATCAGAGGATCCTTACCAGTGCCGGTGTGACAATGATTGAAGGGGCAGGCAGTCTAGTTGATGCTCATA


Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
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