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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ATATTCTCGTACTTCTGCTCCTAGTGTATGGGCTGTGGGTGATGTAACAAACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggttgcagtagagatcgctttagttctttgtaactggtagttccttacccttttcacactttcaactgcag

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM5G806449_T03
intron # 12
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM5G806449_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 12
lower sequence: LOC_Os02g56850.4 (Oryza sativa), 5'ss of exon 9
ATATTCTCGTACTTCTGCTCCTAGTGTATGGGCTGTGGGTGATGTAACAAACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggttgcagtaga----gatcgcttt-------------------agttctttgtaactg-gtagttccttacccttttcacactttcaactgcag
 ||||||||||| || |  || | | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||  | ||||        ||| | ||                   | ||||||||  ||| |||       ||  |  |   |  || || |||||
TTATTCTCGTACATCAGTCCCAAATATATGGGCTGTGGGTGATGTAACGAACCGGATAAATTTAACACCTGTTGCACTGATGGAGGCTACCTGCTTTTCTgtaagtgactacagtgactcataatccccttgtaaattgggtgtgttcaaatttctttgtttctgtgtaaccagcaactttactttaatctttaattgcag

upper sequence: GRMZM5G806449_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 12
lower sequence: GLYMA16G27210.1 (Glycine max), 5'ss of exon 12
ATATTCTCGTACTTCTGCTCCTAGTGTATGGGCTGTGGGTGATGTAACAAACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggttg------cagtagaga-------tcgctttagttctttgtaa-------ctggtagttccttacccttttcacactttcaactgcag------------------------
 ||||| || ||       |||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| || || || |||||||| ||| | | |||||||||||||  |         ||| || |           ||  || ||  |||         | | ||||  ||   ||  | |   | | |  ||  |                        
GTATTCCCGCACAAGCATACCTAGCATATGGGCTGTGGGTGATGTCACAAACCGAATGAATCTAACTCCGGTGGCCTTGATGGAAGCATCGTACTTTGCTgtaagtattcagatatttagtggataagaatacctatttatgtactgggtagggaggagtttgcagttgattggtctaatgatgatattatttgttgttgtttaacatatttgttttgcag

upper sequence: GRMZM5G806449_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 12
lower sequence: GLYMA02G08180.1 (Glycine max), 5'ss of exon 11
ATATTCTCGTACTTCTGCTCCTAGTGTATGGGCTGTGGGTGATGTAACAAACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggttgcag---tagag-atcgctttagttctttgta---------------actggtagttccttacccttttcacactttcaactgcag------------------------
 |||||  | ||       |||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | || || || || |||||||| ||| | | |||||||||||||  |   |    ||| | ||   | ||  | ||| |                |   | ||||  ||   ||  | |   | | |  ||  |                        
GTATTCCTGCACAAGCATACCTAGCATATGGGCTGTGGGTGATGTCACAAACCGAATGAATCTTACTCCGGTGGCCTTGATGGAAGCATCGTACTTTGCTgtaagtattcagatatttagtgtataagtatacctatttatggagtgggtagggaggagcagcagttgattggtctagtgatgatcttatttgttgttgtttgacatttttgttatgcag

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|19350945|gb|BM895477.1|BM895477
EST:     TTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: TTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|76293304|gb|DV032872.1|DV032872
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|19350946|gb|BM895478.1|BM895478
EST:     ACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|32845839|gb|CD985520.1|CD985520
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|211368053|gb|FL471715.1|FL471715
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCTTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|62550294|gb|DN830714.1|DN830714
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|67018787|gb|CO447536.1|CO447536
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|8368856|gb|BE051801.1|BE051801
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTATATAATGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCC
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTT-TGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCC
EST: gi|47961792|gb|CN844501.1|CN844501
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|58030045|gb|CX725472.1|CX725472
EST:     GGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: GGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|37380707|gb|CF627182.1|CF627182
EST:     TGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTG-TTGTGTGGCCAGCAAGTAAAGCCTGATCACAGAGATGTTCT
genomic: TGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTG-GTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCC
EST: gi|67026810|gb|CO455559.1|CO455559
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         NAAACTGTGTTTGGTGGGCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGT-CCN
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCC-
EST: gi|71757895|gb|DR955832.1|DR955832
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|76012766|gb|DT939936.1|DT939936
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|16916633|gb|BM072928.1|BM072928
EST:     CGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: CGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|110942635|gb|EE162792.1|EE162792
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGGTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|211135367|gb|FL349825.1|FL349825
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTAATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCAC
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCAC
EST: gi|32919439|gb|CF024251.1|CF024251
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|91056621|gb|EB167039.1|EB167039
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGTT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|56382549|gb|CV985218.1|CV985218
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|47961736|gb|CN844445.1|CN844445
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|51593048|gb|CV072194.1|CV072194
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|31664369|gb|CD573094.1|CD573094
EST:     ATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|37377035|gb|CF625088.1|CF625088
EST:     CGGGATTAATTTAACACCTG-TGCATTTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: C-GGATTAATTTAACACCTGTTGCA-TTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|14243079|gb|BG840745.2|BG840745
EST:     TTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: TTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|47962782|gb|CN845491.1|CN845491
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|211540781|gb|FL336428.1|FL336428
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTAATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAG
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAG
EST: gi|32939543|gb|CF044362.1|CF044362
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|30088227|gb|CB886432.1|CB886432
EST:     ATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|71311903|gb|DR792430.1|DR792430
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|108823920|gb|EC277928.1|EC277928
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATCGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTCNCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|148937230|gb|EC881412.2|EC881412
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
EST: gi|149077607|gb|EE166307.2|EE166307
EST:     ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCT                         AAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT
genomic: ACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCT

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 4 RNA-Seq libraries.


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 350

ATATTCTCGTACTTCTGCTCCTAGTGTATGGGCTGTGGGTGATGTAACAAACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCTTGTGCTGTTTTCTC


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 2551

ATATTCTCGTACTTCTGCTCCTAGTGTATGGGCTGTGGGTGATGTAACAAACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCTTGTGCTGTTTTCTC


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 1967

ATATTCTCGTACTTCTGCTCCTAGTGTATGGGCTGTGGGTGATGTAACAAACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCTTGTGCTGTTTTCTC


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 505

ATATTCTCGTACTTCTGCTCCTAGTGTATGGGCTGTGGGTGATGTAACAAACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggtt ... tcaactgcagAAAACTGTGTTTGGTGGCCAGCAAGTTAAGCCTGATCACAGAGATGTTCCTTGTGCTGTTTTCTC


Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
ATATTCTCGTACTTCTGCTCCTAGTGTATGGGCTGTGGGTGATGTAACAAACCGGATTAATTTAACACCTGTTGCATTGATGGAGGCAACTTGCTTTGCTgtaagtggttgcagtagagatcgctttagttctttgtaactggtagttccttacccttttcacactttcaactgcag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GATGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGG