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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GAGTGGATCTGGCACGGGCCTCAAAGATCTCCCATACAATATCGGTGAACCTTATGCTTCTGCTTGGGGCTCTTGGCTTCATTTTCGCGGCACCTCCAAGgtaactcactcactctcacttcttctaattcatatactcctaactccaacattatgtacataatattaccttcaatttggaactaaacctgactaatttcacgttgatttggttttggtttcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G36180.1
intron # 1
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA20G36180.1 (Glycine max), 5'ss of exon 1
lower sequence: AT2G40730.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 1
GAGTGGATCTGGCACGGGCCTCAAAGATCTCCCATACAATATCGGTGAACCTTATGCTTCTGCTTGGGGCTCTTGGCTTCATTTTCGCGGCACCTCCAAGgtaactcactcactctcacttcttctaattcatatactcctaactccaacattatgtacataatattaccttcaatttggaactaaacctgactaatttcacgttgatttggttttggtttcag
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GGCTGGATCTGGGACGGGACTCAAGGATCTACCTTATAACATCGGTGATCCTTATCCTTCTGCTTGGGGTTCATGGAGTCACTTTCGTGGTACCTCCAAGgttatttctcttttctcccctctc----tccggatgtttgtaattctgcgttttttttcttcctgttactt---gctttgatcttagct---cttctttctagtattttt--------------