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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTTATTGGGCTATTATCCACTGGGATTGACAACTGGGGACATgtaagtataatattgctttatttatatctcacattttgtaattctttcttcaattaaaacttaaagagacaatcttttgcaagttaacgagtgtatcagt...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA08G19760.1
intron # 8
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|207848077|gb|GD820530.1|GD820530
EST:     TTATTGGGCTATTATCCACTGGGATTGACAACTGGGGACAT                         TTAGGAGGGTTGGTTGGTGGAGTTGCTGCATCATGGTTTATTGGACCGGCA
genomic: TTATTGGGCTATTATCCACTGGGATTGACAACTGGGGACATgtaagtataa ... tatatttcagTTAGGAGGGTTGGTTGGTGGAGTTGCTGCATCATGGTTTATTGGACCGGCA
EST: gi|24205186|gb|BU964439.1|BU964439
EST:     GGCTATTATCCACTGGGATTGACAACTGGGGACAT                         TTAGGAGGGTTGGTTGGTGGAGTTGCTGCATCATGGTTTATTGGACCGGCA
genomic: GGCTATTATCCACTGGGATTGACAACTGGGGACATgtaagtataa ... tatatttcagTTAGGAGGGTTGGTTGGTGGAGTTGCTGCATCATGGTTTATTGGACCGGCA
EST: gi|51335914|gb|CO979780.1|CO979780
EST:     GGGCTATTATCCACTGGGATTGACAACTGGGGACAT                         TTAGGAGGGTTGGTTGGTGGAGTTGCTGCATCATGGTTTATTGGACCGGCA
genomic: GGGCTATTATCCACTGGGATTGACAACTGGGGACATgtaagtataa ... tatatttcagTTAGGAGGGTTGGTTGGTGGAGTTGCTGCATCATGGTTTATTGGACCGGCA
EST: gi|58020307|gb|CX707049.1|CX707049
EST:     GTTATTGGGCTATTATCCACTGGGATTGACAACTGGGGACAT                         TTAGGAGGGTTGGTTGGTGGAGTTGCTGCATCATGGTTTATTGGACCGGCA
genomic: GTTATTGGGCTATTATCCACTGGGATTGACAACTGGGGACATgtaagtataa ... tatatttcagTTAGGAGGGTTGGTTGGTGGAGTTGCTGCATCATGGTTTATTGGACCGGCA
EST: gi|58016763|gb|CX703505.1|CX703505
EST:     GTTATTGGGCTATTATCCACTGGGATTGACAACTGGGGACAT                         TTAGGAGGGTTGGTTGGTGGAGTTGCTGCATCATGGTTTATTGGACCGGCA
genomic: GTTATTGGGCTATTATCCACTGGGATTGACAACTGGGGACATgtaagtataa ... tatatttcagTTAGGAGGGTTGGTTGGTGGAGTTGCTGCATCATGGTTTATTGGACCGGCA