Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTGGAGACTTGTGGAAATTGATGCTGACTTGTCAGACTTGGTGTTCGAAACTAGTCATGTTATGTCCCTCATAAATCCTGCCAACACCTACATGgtactaattaatgctctggatctgtaatttataatattattctatcatgcataaactttctagttgctttaaggatttgaattatcaaccaactgcaact...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G03040.1
intron # 9
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|193632582|gb|FK584294.1|FK584294
EST:     TCGAAACTAGTCATGTTATGTCCCTCATAAATCCTGCCAACACCTACATG                         GACCTGAATATTGGAATTGCTTTATGGCTTGCTGCTGGTGGTGATGGATGG
genomic: TCGAAACTAGTCATGTTATGTCCCTCATAAATCCTGCCAACACCTACATGgtactaatta ... atcttttcagGACCTGAATATTGGAATTGCTTTATGGCTTGCTGCTGGTGGTGATGGATGG
EST: gi|4397242|gb|AI496239.1|AI496239
EST:     TCGAAACTAGTCATGTTATGTCCCTCATAAATCCTGCCAACACCTACATG                         GACCTGAATATTGGAATTGCTTTATGGCTTGCTGCTGGTGGTGATGGATGG
genomic: TCGAAACTAGTCATGTTATGTCCCTCATAAATCCTGCCAACACCTACATGgtactaatta ... atcttttcagGACCTGAATATTGGAATTGCTTTATGGCTTGCTGCTGGTGGTGATGGATGG
EST: gi|120529547|gb|EH257681.1|EH257681
EST:     TCGAAACTAGTCATGTTATGTCCCTCATAAATCCTGCCAACACCTACATG                         GACCTGAATATTGGAATTGCTTTATGGCTTGCTGCTGGTGGTGATGGATGG
genomic: TCGAAACTAGTCATGTTATGTCCCTCATAAATCCTGCCAACACCTACATGgtactaatta ... atcttttcagGACCTGAATATTGGAATTGCTTTATGGCTTGCTGCTGGTGGTGATGGATGG
EST: gi|23064094|gb|BU578867.1|BU578867
EST:     TCGAAACTAGTCATGTTATGTCCCTCATAAATCCTGCCAACACCTACATG                         GACCTGAATATTGGAATTGCTTTATGGCTTGCTGCTGGTGGTGATGGATGG
genomic: TCGAAACTAGTCATGTTATGTCCCTCATAAATCCTGCCAACACCTACATGgtactaatta ... atcttttcagGACCTGAATATTGGAATTGCTTTATGGCTTGCTGCTGGTGGTGATGGATGG