Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTGCCACTCAGAATTCAATCAAGGTTGCTCAAgtatgtatctaccttgttagtgcttagtaatactctgaatctatattagctttggtcaaagcaatttaccctttacttttgcttcttgtag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA19G36630.1
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|192295218|gb|FG986937.1|FG986937
EST:     GTGCCACTCAGAATTCAATCAAGGTTGCTCAA                         TGGATGCTCCAAGTTCCTGGTGCAACAAGTTACATGGGTGGCATAGGAAAG
genomic: GTGCCACTCAGAATTCAATCAAGGTTGCTCAAgtatgtatct ... cttcttgtagTGGATGCTCCAAGTTCCTGGTGCAACAAGTTACATGGGTGGCATAGGAAAG
EST: gi|151393153|gb|EV263028.1|EV263028
EST:     GTGCCACTCAGAATTCAATCAAGGTTGCTCAA                         TGGATGCTCCAAGTTCCTGGTGCAACAAGTTACATGGGTGGCATAGGAAAG
genomic: GTGCCACTCAGAATTCAATCAAGGTTGCTCAAgtatgtatct ... cttcttgtagTGGATGCTCCAAGTTCCTGGTGCAACAAGTTACATGGGTGGCATAGGAAAG
EST: gi|26045675|gb|CA783183.1|CA783183
EST:     GTGCCACTCAGAATTCAATCAAGGTTGCTCAA                         TGGATGCTCCAAGTTCCTGGTGCAACAAGTTACATGGGTGGCATAGGAAAG
genomic: GTGCCACTCAGAATTCAATCAAGGTTGCTCAAgtatgtatct ... cttcttgtagTGGATGCTCCAAGTTCCTGGTGCAACAAGTTACATGGGTGGCATAGGAAAG
EST: gi|298170787|gb|HO015763.1|HO015763
EST:     GTGCCACTCAAAATTCAATCAAGGTTGCTCAA                         TGGATGCTCCAAGTTCCTGGTGCAACAAGTTACATGGGTGGCATAGGAAAG
genomic: GTGCCACTCAGAATTCAATCAAGGTTGCTCAAgtatgtatct ... cttcttgtagTGGATGCTCCAAGTTCCTGGTGCAACAAGTTACATGGGTGGCATAGGAAAG
EST: gi|192304064|gb|FG993894.1|FG993894
EST:     GTGCCACTCAGAATTCAATCAAGGTTGCTCAA                         TGGATGCTCCAAGTTCCTGGTGCAACAAGTTACATGGGTGGCATAGGAAAG
genomic: GTGCCACTCAGAATTCAATCAAGGTTGCTCAAgtatgtatct ... cttcttgtagTGGATGCTCCAAGTTCCTGGTGCAACAAGTTACATGGGTGGCATAGGAAAG
EST: gi|298177311|gb|HO027092.1|HO027092
EST:     GTGCCACTCAGAATTCAATCAAGGTTGCTCAA                         TGGATGCTCCAAGTTCCTGGTGCAACAAGTTACATGGGTGGCATAGGAAAG
genomic: GTGCCACTCAGAATTCAATCAAGGTTGCTCAAgtatgtatct ... cttcttgtagTGGATGCTCCAAGTTCCTGGTGCAACAAGTTACATGGGTGGCATAGGAAAG
EST: gi|298165993|gb|HO008964.1|HO008964
EST:     GTGCCACTCAGAATTCAATCAAGGTTGCTCAA                         TGGATGCTCCAAGTTCCTGGTGCAACAAGTTACATGGGTGGCATAGGAAAG
genomic: GTGCCACTCAGAATTCAATCAAGGTTGCTCAAgtatgtatct ... cttcttgtagTGGATGCTCCAAGTTCCTGGTGCAACAAGTTACATGGGTGGCATAGGAAAG
EST: gi|298182073|gb|HO026248.1|HO026248
EST:     GTGCCACTCAGAATTCAATCAAGGTTGCTCAA                         TGGATGCTCCAAGTTCCTGGTGCAACAAGTTACATGGGTGGCATAGGAAAG
genomic: GTGCCACTCAGAATTCAATCAAGGTTGCTCAAgtatgtatct ... cttcttgtagTGGATGCTCCAAGTTCCTGGTGCAACAAGTTACATGGGTGGCATAGGAAAG
EST: gi|26045783|gb|CA783264.1|CA783264
EST:     GTGCCACTCAGAATTCAATCAAGGTTGCTCAA                         TGGATGCTCCAAGTTCCTGGTGCAACAAGTTACATGGGTGGCATAGGAAAG
genomic: GTGCCACTCAGAATTCAATCAAGGTTGCTCAAgtatgtatct ... cttcttgtagTGGATGCTCCAAGTTCCTGGTGCAACAAGTTACATGGGTGGCATAGGAAAG