1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
CTACCCAGAAGACTGTTGATGGACCATCAGCCAAGGACTGGAGAGGTGGAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattttatatgatttgttgtgttgtttcttgctcatgaacaccaaatttaattgtttatagtcaacacatttttttggttttactgattcctactttttttgtgcaag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA06G18110.1 |
intron # | 8 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|19937192|gb|BQ081190.1|BQ081190
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|16281862|gb|BI944708.1|BI944708
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCEST: gi|21675804|gb|BQ628155.1|BQ628155
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTC
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|16996724|gb|BM086096.1|BM086096
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|16276402|gb|BI941840.1|BI941840
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|16282203|gb|BI944890.1|BI944890
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|17963223|gb|BM269974.1|BM269974
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|24136619|gb|BU927129.1|BU927129
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|193347754|gb|FK310630.1|FK310630
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|193395764|gb|FK364389.1|FK364389
genomic: GCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTAEST: gi|16277514|gb|BI942422.1|BI942422
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|37997667|gb|CF809256.1|CF809256
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: AGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|20497911|gb|BQ272841.1|BQ272841
genomic: AGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|21637795|gb|BM107950.1|BM107950
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAARAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|37995973|gb|CF807562.1|CF807562
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCANCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATEST: gi|16279470|gb|BI943453.1|BI943453
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAAT
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|209706837|gb|BW653129.1|BW653129
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: AAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCTCA-G GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCEST: gi|16278226|gb|BI942793.1|BI942793
genomic: AAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGC-CAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGC
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGNCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATEST: gi|31560882|gb|CD486720.1|CD486720
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAAT
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|298189237|gb|HO037640.1|HO037640
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTACGGCAEST: gi|254320366|gb|GR826383.1|GR826383
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|254334654|gb|GR844439.1|GR844439
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|208193765|gb|GD993364.1|GD993364
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|193640048|gb|FK587141.1|FK587141
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTGGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|209725750|gb|BW659879.1|BW659879
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAA-TTGACTGGTATGGCAEST: gi|16277472|gb|BI942399.1|BI942399
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: ATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|16280570|gb|BI944030.1|BI944030
genomic: ATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAA-GTCCTCCCTGCTNTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|42722505|gb|CK768404.1|CK768404
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAA GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGEST: gi|23053006|gb|BU577497.1|BU577497
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTG
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|16280511|gb|BI944000.1|BI944000
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATNGACTGGTATGGCAEST: gi|21601131|gb|BQ611462.1|BQ611462
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|208056494|gb|GD850295.1|GD850295
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCCGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|22523984|gb|BU082795.1|BU082795
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|17401445|gb|BM178227.1|BM178227
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|193604411|gb|FK559432.1|FK559432
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTGGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|16278605|gb|BI942990.1|BI942990
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|24136374|gb|BU926884.1|BU926884
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|22525989|gb|BU084800.1|BU084800
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|16281901|gb|BI944728.1|BI944728
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|16279550|gb|BI943494.1|BI943494
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|16280437|gb|BI943962.1|BI943962
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|254322211|gb|GR837625.1|GR837625
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|16279498|gb|BI943467.1|BI943467
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|207847163|gb|GD820810.1|GD820810
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGAAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|20207898|gb|BQ133987.1|BQ133987
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAACAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATEST: gi|208292312|gb|GE092412.1|GE092412
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAAT
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|16278876|gb|BI943140.1|BI943140
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|298191818|gb|HO035900.1|HO035900
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|16284345|gb|BI946035.1|BI946035
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|15815889|gb|BI788164.1|BI788164
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: ACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|213600703|gb|DB968793.1|DB968793
genomic: ACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|37996056|gb|CF807645.1|CF807645
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAANATTGACTGGTATGGCEST: gi|16277350|gb|BI942334.1|BI942334
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCT-GTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGC
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|17153829|gb|BM143762.1|BM143762
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCEST: gi|22524886|gb|BU083697.1|BU083697
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCC
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|48574825|gb|CO036096.1|CO036096
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|193638713|gb|FK586871.1|FK586871
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|17401792|gb|BM178574.1|BM178574
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|37994123|gb|CF805869.1|CF805869
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAAEST: gi|193631193|gb|FK584578.1|FK584578
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|15664053|gb|BI701424.1|BI701424
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGNCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTEST: gi|27445931|gb|CA953054.1|CA953054
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCT
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|208121298|gb|GD917117.1|GD917117
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCEST: gi|16281890|gb|BI944722.1|BI944722
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTC
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|208076691|gb|GD875620.1|GD875620
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: CTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|27425391|gb|CA936911.1|CA936911
genomic: CTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|208261017|gb|GE057841.1|GE057841
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|208246744|gb|GE046260.1|GE046260
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: AGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTT-GGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|192322837|gb|FK014768.1|FK014768
genomic: AGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|298197763|gb|HO039302.1|HO039302
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|27808905|gb|CB063327.1|CB063327
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|15589743|gb|BI674359.1|BI674359
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|20498687|gb|BQ273617.1|BQ273617
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|26057093|gb|CA800007.1|CA800007
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|120493096|gb|EH221263.1|EH221263
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: AAGAGCTGCTTCATTNTA-CATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAGG GCTGT-GGGAAAGTCCEST: gi|16279444|gb|BI943440.1|BI943440
genomic: AAGAGCTGCTTCATT-TAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCC
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|21601528|gb|BQ611859.1|BQ611859
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|18730217|gb|BM525752.1|BM525752
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAEST: gi|19054169|gb|BM732836.1|BM732836
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCAEST: gi|254332667|gb|GR844037.1|GR844037
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
EST: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAG GCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
genomic: GAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattt ... tttgtgcaagGCTGTTGGGAAAGTCCTCCCTGCTTTGAATGGAAAATTGACTGGTATGGCA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CTACCCAGAAGACTGTTGATGGACCATCAGCCAAGGACTGGAGAGGTGGAAGAGCTGCTTCATTTAACATCATTCCTAGCAGCACTGGAGCTGCCAAGgtgaatattttatatgatttgttgtgttgtttcttgctcatgaacaccaaatttaattgtttatagtcaacacatttttttggttttactgattcctactttttttgtgcaag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTGC