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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TGACTATTTCAAGCAAACCTACACAGAGCCTATTTCTTCTGCGTACTTTCCATGCCTTGATGTTGGCAAGCCAGATCGGCCCAACTATCTTCCACTGGAGgtatccatctccagcagtgtttccttcgttaatttttttgtagtctcttatcccacttctggaggtgtgtatgtttgaacttctaattcttttcttgcag

Basic information

species Arabidopsis thaliana
transcript AT2G32940.1
intron # 8
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: AT2G32940.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 8
lower sequence: Vv12s0059g01430.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 8
TGACTATTTCAAGCAAACCTACACAGAGCCTATTTCTTCTGCGTACTTTCCATGCCTTGATGTTGGCAAGCCAGATCGGCCCAACTATCTTCCACTGGAGgtatccatctccagcagtgtttccttcgttaatttttttgtagtctcttatcccacttctggaggtgtgtatgtttgaacttctaattcttttcttgcag
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ATATTTTACTAAACACCGTGGCATAGAACTATCCATTTCTGCTTACATGCCATGCCTTAATGTTGGAAAGCCAAAACGACCCAACTATCTACCCCTGGAGgtttgcaaatcct----tgttcttgatataatgttttattcactagattattttgtgctttgctttcc-tctaatttttttttccgttgttgtattccag