1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' |
gtaagcaaagtttgtgtgtttatttcacacacaaaaaaatcgtggcattttccagtcttcactagtattttgcacctgactttccaccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCACT
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os02g56850.1 |
intron # | 15 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|86251596|gb|CI016885.1|CI016885
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88848384|gb|CI086906.1|CI086906
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88254847|gb|CI351475.1|CI351475
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|86431565|gb|CI085176.1|CI085176
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|9886227|gb|AU102120.1|AU102120
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88217368|gb|CI217217.1|CI217217
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88323267|gb|CI553512.1|CI553512
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88459892|gb|CI524351.1|CI524351
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|86522150|gb|CI162356.1|CI162356
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|89184506|gb|CI047071.1|CI047071
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|29670416|gb|CB666691.1|CB666691
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88295376|gb|CI527739.1|CI527739
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: TCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|27578226|gb|CB000921.1|CB000921
genomic: TCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGEST: gi|29675049|gb|CB671324.1|CB671324
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGG
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|86434618|gb|CI105851.1|CI105851
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|18385573|gb|BM418772.1|BM418772
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATCATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|87015137|gb|CI273535.1|CI273535
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88455858|gb|CI526674.1|CI526674
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88460573|gb|CI532046.1|CI532046
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88320835|gb|CI527987.1|CI527987
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|86594898|gb|CI258152.1|CI258152
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|86489073|gb|CI131706.1|CI131706
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88319637|gb|CI520680.1|CI520680
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88256324|gb|CI358712.1|CI358712
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|33675534|gb|CF303773.1|CF303773
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88841227|gb|CI080681.1|CI080681
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|58686026|gb|CK074713.1|CK074713
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATCATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|89198081|gb|CI117559.1|CI117559
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|89185441|gb|CI051769.1|CI051769
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|33682254|gb|CF310493.1|CF310493
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|29625188|gb|CB630199.1|CB630199
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATCATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|86603737|gb|CI112497.1|CI112497
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88274060|gb|CI394466.1|CI394466
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88964176|gb|CI045369.1|CI045369
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|86603354|gb|CI112114.1|CI112114
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCNCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGEST: gi|88957187|gb|CI095173.1|CI095173
genomic: AGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATC-CAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAG
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATTCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88833560|gb|CI077041.1|CI077041
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|86426951|gb|CI072048.1|CI072048
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|89187152|gb|CI047219.1|CI047219
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88408891|gb|CI554213.1|CI554213
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88966781|gb|CI366004.1|CI366004
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTAGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGEST: gi|86594937|gb|CI258191.1|CI258191
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAG-CGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAG
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|87014199|gb|CI273389.1|CI273389
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGGCCTTTGACAGCEST: gi|396941644|gb|HO188301.1|HO188301
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATCATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88845181|gb|CI084106.1|CI084106
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|89190847|gb|CI392700.1|CI392700
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTTTGGACCAGATGCACCAGACATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTTGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACACCEST: gi|218481326|gb|FG969724.1|FG969724
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATCATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|86430740|gb|CI083163.1|CI083163
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGACTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88257343|gb|CI359731.1|CI359731
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTGCTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGGGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|86872978|gb|CI326975.1|CI326975
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|86426091|gb|CI071188.1|CI071188
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88955687|gb|CI091976.1|CI091976
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88849681|gb|CI089787.1|CI089787
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88838759|gb|CI376297.1|CI376297
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AGGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88848329|gb|CI086851.1|CI086851
genomic: A-GTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88460680|gb|CI534552.1|CI534552
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88906458|gb|CI375530.1|CI375530
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTTTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|86896270|gb|CI330158.1|CI330158
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTTGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88955638|gb|CI091927.1|CI091927
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|86526760|gb|CI166966.1|CI166966
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88253128|gb|CI351754.1|CI351754
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|86845452|gb|CI340491.1|CI340491
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88257486|gb|CI359874.1|CI359874
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|89188782|gb|CI048518.1|CI048518
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|86602727|gb|CI357091.1|CI357091
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: GATGCACCAGAGATTATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|88248383|gb|CI248232.1|CI248232
genomic: GATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATNATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCEST: gi|86429566|gb|CI076247.1|CI076247
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
EST: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATAATCCAG GGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
genomic: AAGTACTTGGTGCATCAATGTGTGGACCAGATGCACCAGAGATTATCCAGgtaagcaaag ... ccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGC
gtggcattttccagtcttcactagtattttgcacctgactttccaccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCACT
acctgac putative branch site (score: 47)
ctttccacc CT-rich tract
tagtatttt TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| gtaagcaaagtttgtgtgtttatttcacacacaaaaaaatcgtggcattttccagtcttcactagtattttgcacctgactttccaccaattgcagGGTATGGCTGTAGCGCTGAAGTGTGGAGCCACCAAGGCGACCTTTGACAGCACT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GTGGAG