Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtatgtcgtgagttttgtttcagtctacagttactgaacatgtggaaatcattgctgtgacgcctatattattaattgagcaatatatcgtaatgtcaagttgttagggtacctcaatagaatttcacttgtttaaatttacagtaatattttcttgtttttcttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATGCTGCGCACGTCTTTTGCGGACACCTTAAGAAGGTTGCGAATATACATGT

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os01g71590.3
intron # 8
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|86862939|gb|CI331747.1|CI331747
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|86598386|gb|CI355003.1|CI355003
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88265806|gb|CI376708.1|CI376708
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|86538290|gb|CI178496.1|CI178496
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88692165|gb|CI735740.1|CI735740
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|89187130|gb|CI047197.1|CI047197
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88275812|gb|CI396416.1|CI396416
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88971115|gb|CI387134.1|CI387134
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|86524482|gb|CI164688.1|CI164688
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|10931095|gb|AU161369.1|AU161369
EST:     TGCTGCATTCAAAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCNAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: TGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88275437|gb|CI395288.1|CI395288
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88269537|gb|CI380835.1|CI380835
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|89195540|gb|CI051653.1|CI051653
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCCAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88490720|gb|CI427992.1|CI427992
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|89196956|gb|CI021796.1|CI021796
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88437070|gb|CI524020.1|CI524020
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88969258|gb|CI382807.1|CI382807
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88836046|gb|CI371151.1|CI371151
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|89177685|gb|CI390864.1|CI390864
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88411674|gb|CI521397.1|CI521397
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88730734|gb|CI754347.1|CI754347
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88258028|gb|CI360614.1|CI360614
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAA-GTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAATTATTATC
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88690393|gb|CI734472.1|CI734472
EST:     TGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: TGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|89181159|gb|CI045242.1|CI045242
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88439473|gb|CI536445.1|CI536445
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88839237|gb|CI000709.1|CI000709
EST:     CTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGTCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: CTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTG-CTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|29683286|gb|CB679561.1|CB679561
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88978780|gb|CI385121.1|CI385121
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88465250|gb|CI517419.1|CI517419
EST:     AATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: AATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88967155|gb|CI392117.1|CI392117
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTTTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88253315|gb|CI351941.1|CI351941
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88989951|gb|CI018828.1|CI018828
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88382113|gb|CI533317.1|CI533317
EST:     CTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: CTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|86871615|gb|CI342414.1|CI342414
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGT-GATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88271836|gb|CI387889.1|CI387889
EST:     ACTGCTGCATTCAG-ATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88845257|gb|CI084182.1|CI084182
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGGCATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|33801197|gb|CF326472.1|CF326472
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88266981|gb|CI378916.1|CI378916
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|86538320|gb|CI178526.1|CI178526
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88457509|gb|CI536907.1|CI536907
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|89190932|gb|CI392785.1|CI392785
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88835080|gb|CI370383.1|CI370383
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88291247|gb|CI527637.1|CI527637
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|86843271|gb|CI341394.1|CI341394
EST:     CTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: CTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGT-GCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88266598|gb|CI377500.1|CI377500
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|89179618|gb|CI391951.1|CI391951
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|27554312|gb|CA998212.1|CA998212
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88253310|gb|CI351936.1|CI351936
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|29683285|gb|CB679560.1|CB679560
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88840621|gb|CI080075.1|CI080075
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTACG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88842544|gb|CI081800.1|CI081800
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|86538330|gb|CI178536.1|CI178536
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88271414|gb|CI387467.1|CI387467
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|7332571|gb|AU085917.1|AU085917
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTAAT
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTA-T
EST: gi|88719987|gb|CI745286.1|CI745286
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88261409|gb|CI364985.1|CI364985
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88477792|gb|CI415063.1|CI415063
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88995486|gb|CI022809.1|CI022809
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88411552|gb|CI521275.1|CI521275
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|89177989|gb|CI391168.1|CI391168
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88485171|gb|CI422442.1|CI422442
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88380499|gb|CI521068.1|CI521068
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88975649|gb|CI021731.1|CI021731
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88845066|gb|CI083991.1|CI083991
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|86907691|gb|CI296634.1|CI296634
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|86868698|gb|CI333075.1|CI333075
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88264564|gb|CI368338.1|CI368338
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|89188173|gb|CI115422.1|CI115422
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCCAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88443897|gb|CI552442.1|CI552442
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88321455|gb|CI535407.1|CI535407
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|33673284|gb|CF301523.1|CF301523
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|86822219|gb|CI357845.1|CI357845
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|163918082|gb|EG715258.1|EG715258
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|86599318|gb|CI355935.1|CI355935
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88516658|gb|CI444312.1|CI444312
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88845052|gb|CI083977.1|CI083977
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|86429181|gb|CI075862.1|CI075862
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|86538352|gb|CI178558.1|CI178558
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88960133|gb|CI382011.1|CI382011
EST:     GGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: GGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|33691043|gb|CF319282.1|CF319282
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTTTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|55409816|gb|CV722192.1|CV722192
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88272314|gb|CI386768.1|CI386768
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88273862|gb|CI394268.1|CI394268
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88976991|gb|CI257687.1|CI257687
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|86873327|gb|CI341552.1|CI341552
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88487648|gb|CI424919.1|CI424919
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|29680927|gb|CB677202.1|CB677202
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88218544|gb|CI218393.1|CI218393
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
EST: gi|88997564|gb|CI390230.1|CI390230
EST:     ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAG                         GTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG
genomic: ACTGCTGCATTCAGAATGCTCACGAAGGTGCTAAAGACATGAGCAAAAAGgtatgtcgtg ... cttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATG


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tagaatttcacttgtttaaatttacagtaatattttcttgtttttcttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATGCTGCGCACGTCTTTTGCGGACACCTTAAGAAGGTTGCGAATATACATGT
                              tattttcttgtttttc  CT-rich tract
           ttgtttaaatttacag  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
gtatgtcgtgagttttgtttcagtctacagttactgaacatgtggaaatcattgctgtgacgcctatattattaattgagcaatatatcgtaatgtcaagttgttagggtacctcaatagaatttcacttgtttaaatttacagtaatattttcttgtttttcttcgtgcagGTGCCTAGTGGCATGTTGCTGTTGATAACCATAGGTCTGCAAAGTATTATGCTGCGCACGTCTTTTGCGGACACCTTAAGAAGGTTGCGAATATACATGT

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AAGAAG