Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   		22  
 5'  3'   		23  
 5'  3'   		24  
 5'  3'   		25  
 5'  3'   		26  
 5'  3'   		27  
 5'  3'   		28  
 5'  3'   		29  
 5'  3'   		30  
 5'  3'   		31  
 5'  3'   		32  
 5'  3'   		33  
 5'  3'   		34  
 5'  3'   		35  
 5'  3'   		36  
 5'  3'   		37  
 5'  3'   		38  
 5'  3'   		39  
 5'  3'   		40  
 5'  3'   
41  
 5'  3'   		42  
 5'  3'   		43  
 5'  3'   		44  
 5'  3'   		45  
 5'  3'   		46  
 5'  3'   		47  
 5'  3'   		48  
 5'  3'   		49  
 5'  3'   		50  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AGAGTTGTGGCAACAAAGGGCACCAAGTCTGAATCAATATCTGTTCAAGATATAGCGGTCCAGTCTCAGGCCTTGTTAAATATCAAGGATTCAAATAAGgtattgttggctgaactggagtaataccaaacgttgtttaaaatcttacaaatatgtggttggactgtcatttggattgtcttacatgcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G32430.2
intron # 33
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|207817846|gb|GD789751.1|GD789751
EST:     ATATAGCGGTCCAGTCTCAGGCCTTGTTAAATATCAAGGATTCAAATAAG                         GAAGATCGAGAGAGAATGGTGGTTCGAAGGTTTAAGTTTGAGGATCCACGT
genomic: ATATAGCGGTCCAGTCTCAGGCCTTGTTAAATATCAAGGATTCAAATAAGgtattgttgg ... ttacatgcagGAAGATCGAGAGAGAATGGTGGTTCGAAGGTTTAAGTTTGAGGATCCACGT
EST: gi|193521887|gb|FK480780.1|FK480780
EST:     ATATAGCGGTCCAGTCTCAGGCCTTGTTAAATATCAAGGATTCAAATAAG                         GAAGATCGAGAGAGAATGGTGGTTCGAAGGTTTAAGTTTGAGGATCCACGT
genomic: ATATAGCGGTCCAGTCTCAGGCCTTGTTAAATATCAAGGATTCAAATAAGgtattgttgg ... ttacatgcagGAAGATCGAGAGAGAATGGTGGTTCGAAGGTTTAAGTTTGAGGATCCACGT