Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ATACCATCAAACCATGCCAAGTCTTATCTATATTCCATCTTCATCAGAACAGGGTTGGTACTTTCTACCCTGGTTATTGGTCTCTCAGTTCCCTTTTTTGgtaagtctttctacttcctattcccatgtcttggttgttgatcaattttactttcaaaggaattgtctcttcaacattatttctttacataacctggaat...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G32260.1
intron # 10
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|58019707|gb|CX706449.1|CX706449
EST:     AGGGTTGGTACTTTCTACCCTGGTTATTGGTCTCTCAGTTCCCTTTTTTG                         GTCTGGTGATGTCATTGATTGGATCATTACTCACAATGCTTGTT
genomic: AGGGTTGGTACTTTCTACCCTGGTTATTGGTCTCTCAGTTCCCTTTTTTGgtaagtcttt ... ttttttacagGTCTGGTGATGTCATTGATTGGATCATTACTCACAATGCTTGTT
EST: gi|209702870|gb|BW655992.1|BW655992
EST:     AGGGTTGGTACTTTCTACCCTGGTTATTGGTCTCTCAGTTCCCTTTTTTG                         GTCTGGTGATGTCATTGATTGGATCATTACTCACAATGCTTGTT
genomic: AGGGTTGGTACTTTCTACCCTGGTTATTGGTCTCTCAGTTCCCTTTTTTGgtaagtcttt ... ttttttacagGTCTGGTGATGTCATTGATTGGATCATTACTCACAATGCTTGTT
EST: gi|16104867|gb|BI892607.1|BI892607
EST:     AGGGTTGGTACTTTCTACCCTGGTTATTGGTCTCTCAGTTCCCTTTTTTG                         GTCTGGTGATGTCATTGATTGGATCATTACTCACAATGCTTGTT
genomic: AGGGTTGGTACTTTCTACCCTGGTTATTGGTCTCTCAGTTCCCTTTTTTGgtaagtcttt ... ttttttacagGTCTGGTGATGTCATTGATTGGATCATTACTCACAATGCTTGTT
EST: gi|209702922|gb|BW656019.1|BW656019
EST:     AGGGTTGGTACTTTCTACCCTGGTTATTGGTCTCTCAGTTCCCTTTTTTG                         GTCTGGTGATGTCATTGATTGGATCATTACTCACAATGCTTGTT
genomic: AGGGTTGGTACTTTCTACCCTGGTTATTGGTCTCTCAGTTCCCTTTTTTGgtaagtcttt ... ttttttacagGTCTGGTGATGTCATTGATTGGATCATTACTCACAATGCTTGTT
EST: gi|9819649|gb|BE555162.1|BE555162
EST:     AGGGTTGGTACTTTCTACCCTGGTTATTGGTCTCTCAGTTCCCTTTTTTG                         GTCTGGTGATGTCATTGATTGGATCATTACTCACAATGCTTGTT
genomic: AGGGTTGGTACTTTCTACCCTGGTTATTGGTCTCTCAGTTCCCTTTTTTGgtaagtcttt ... ttttttacagGTCTGGTGATGTCATTGATTGGATCATTACTCACAATGCTTGTT
EST: gi|58017037|gb|CX703779.1|CX703779
EST:     AGGGTTGGTACTTTCTACCCTGGTTATTGGTCTCTCAGTTCCCTTTTTTG                         GTCTGGTGATGTCATTGATTGGATCATTACTCACAATGCTTGTT
genomic: AGGGTTGGTACTTTCTACCCTGGTTATTGGTCTCTCAGTTCCCTTTTTTGgtaagtcttt ... ttttttacagGTCTGGTGATGTCATTGATTGGATCATTACTCACAATGCTTGTT
EST: gi|209710224|gb|BW653602.1|BW653602
EST:     AGGGTTGGTACTTTCTACCCTGGTTATTGGTCTCTCAGTTCCCTTTTTTG                         GTCTGGTGATGTCATTGATTGGATCATTACTCACAATGCTTGTT
genomic: AGGGTTGGTACTTTCTACCCTGGTTATTGGTCTCTCAGTTCCCTTTTTTGgtaagtcttt ... ttttttacagGTCTGGTGATGTCATTGATTGGATCATTACTCACAATGCTTGTT
EST: gi|15202138|gb|BI425242.1|BI425242
EST:     GGGTTGGTACTTTCTACCCTGGTTATTGGTCTCTCAGTTCCCNNNNNNNG                         GTCTGGTGATGTCATTGATTGGATCATTACTCACAATGCTTGTT
genomic: GGGTTGGTACTTTCTACCCTGGTTATTGGTCTCTCAGTTCCC-TTTTTTGgtaagtcttt ... ttttttacagGTCTGGTGATGTCATTGATTGGATCATTACTCACAATGCTTGTT