1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' | 18 5' 3' | 19 5' 3' | 20 5' 3' |
21 5' 3' |
gttgaaattttatgcacacgtttaggtattcatcattttaaaacagaagtgccattattctgtattttaattgcagGGTCTTGCTCGATCAATGCCAACAAGTGGTGCTTTGGACCGTGTTGCTGAAAAATTGGACCTCCCTTTCTTTGAG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA20G29230.1 |
intron # | 14 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTGCAGCCAATGCAAGAGAAGCGGTTCCATACTTCAAGAATGGTGTTAAG GGTCTTGCTCGATCAATGCCAACAAGTGGTGCTTTGGACCGTGTTGCTGAAEST: gi|14125575|gb|BG790013.1|BG790013
genomic: TTGCAGCCAATGCAAGAGAAGCGGTTCCATACTTCAAGAATGGTGTTAAGgttgaaattt ... ttaattgcagGGTCTTGCTCGATCAATGCCAACAAGTGGTGCTTTGGACCGTGTTGCTGAA
EST: TTGCAGCCAATGCAAGAGAAGCGGTTCCATACTTCAAGAATGGTGTTAAG GGTCTTGCTCGATCAATGCCAACAAGTGGTGCTTTGGACCGTGTTGCTGAAEST: gi|120529768|gb|EH257902.1|EH257902
genomic: TTGCAGCCAATGCAAGAGAAGCGGTTCCATACTTCAAGAATGGTGTTAAGgttgaaattt ... ttaattgcagGGTCTTGCTCGATCAATGCCAACAAGTGGTGCTTTGGACCGTGTTGCTGAA
EST: TTGCAGCCAATGCAAGAGAAGCGGTTCCATACTTCAAGAATGGTGTTAAG GGTCTTGCTCGATCAATGCCAACAAGTGGTGCTTTGGACCGTGTTGCTGAA
genomic: TTGCAGCCAATGCAAGAGAAGCGGTTCCATACTTCAAGAATGGTGTTAAGgttgaaattt ... ttaattgcagGGTCTTGCTCGATCAATGCCAACAAGTGGTGCTTTGGACCGTGTTGCTGAA
ttaggtattcatcattttaaaacagaagtgccattattctgtattttaattgcagGGTCTTGCTCGATCAATGCCAACAAGTGGTGCTTTGGACCGTGTTGCTGAAAAATTGGACCTCCCTTTCTTTGAG
ttttaat putative branch site (score: 3)
attattctgtatttta TA-rich tract