Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTGgtaagaacttgtttcctcttaattgttacatatcaacttgtataaaatagaggagatatttcactacatgtttttaaccatattgtcaagaagaatatag...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA19G36680.1
intron # 5
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|151394863|gb|EV264734.1|EV264734
EST:     GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTG                         CCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
genomic: GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTGgtaagaactt ... gactttgcagCCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
EST: gi|209727236|gb|BW655247.1|BW655247
EST:     GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTG                         CCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
genomic: GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTGgtaagaactt ... gactttgcagCCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
EST: gi|193655938|gb|FK606624.1|FK606624
EST:     GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTG                         CCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCA
genomic: GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTGgtaagaactt ... gactttgcagCCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCA
EST: gi|151397327|gb|EV267200.1|EV267200
EST:     GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTG                         CCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
genomic: GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTGgtaagaactt ... gactttgcagCCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
EST: gi|192300429|gb|FG991471.1|FG991471
EST:     GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTG                         CCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
genomic: GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTGgtaagaactt ... gactttgcagCCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
EST: gi|192332843|gb|FK026844.1|FK026844
EST:     GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTG                         CCAAG-TATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTC
genomic: GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTGgtaagaactt ... gactttgcagCCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTC
EST: gi|31470516|gb|CD412544.1|CD412544
EST:     GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTG                         CCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
genomic: GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTGgtaagaactt ... gactttgcagCCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
EST: gi|8283491|gb|BE021050.1|BE021050
EST:     GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTG                         CCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
genomic: GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTGgtaagaactt ... gactttgcagCCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
EST: gi|192325592|gb|FK019448.1|FK019448
EST:     GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTG                         CCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
genomic: GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTGgtaagaactt ... gactttgcagCCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
EST: gi|298191793|gb|HO035875.1|HO035875
EST:     GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTG                         TCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
genomic: GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTGgtaagaactt ... gactttgcagCCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
EST: gi|192332844|gb|FK026845.1|FK026845
EST:     GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTG                         CCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
genomic: GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTGgtaagaactt ... gactttgcagCCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
EST: gi|31306126|gb|CD391329.1|CD391329
EST:     GTGTCTGTTTAATGTCTAATGAATTG                         CCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
genomic: GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTGgtaagaactt ... gactttgcagCCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
EST: gi|151408235|gb|EV278043.1|EV278043
EST:     GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTCG                         CCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAG
genomic: GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATT-Ggtaagaactt ... gactttgcagCCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAG
EST: gi|308098557|gb|HO760298.1|HO760298
EST:     GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTG                         CCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
genomic: GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTGgtaagaactt ... gactttgcagCCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
EST: gi|192305270|gb|FG993994.1|FG993994
EST:     GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTG                         CCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
genomic: GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTGgtaagaactt ... gactttgcagCCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGTCCAAGG
EST: gi|298180406|gb|HO021959.1|HO021959
EST:     GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTG                         CCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGT
genomic: GTGTCTGTTTTATGTCTAATGAATTGgtaagaactt ... gactttgcagCCAAGGTATGTGGTGAATCAAGTGACAGCTGGGGACTATGATTGT