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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGGttcacttgttttgtgcccgcttatgatgactttatgagggatgaactaaatggaatgtctaactgatttgttcttggaacagt

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA18G08230.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|151397479|gb|EV267352.1|EV267352
EST:     TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGT                         TATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
genomic: TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGGttcacttgtt ... ttggaacagtTATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
EST: gi|38192551|gb|CF921757.1|CF921757
EST:     TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGT                         TATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
genomic: TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGGttcacttgtt ... ttggaacagtTATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
EST: gi|38193812|gb|CF923018.1|CF923018
EST:     TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGT                         TATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
genomic: TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGGttcacttgtt ... ttggaacagtTATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
EST: gi|16349164|gb|BI974759.1|BI974759
EST:     TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGT                         TATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
genomic: TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGGttcacttgtt ... ttggaacagtTATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
EST: gi|192298955|gb|FG987700.1|FG987700
EST:     TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGT                         TATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
genomic: TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGGttcacttgtt ... ttggaacagtTATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
EST: gi|18848425|gb|BM567661.1|BM567661
EST:     TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGT                         TATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
genomic: TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGGttcacttgtt ... ttggaacagtTATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
EST: gi|8283189|gb|BE020750.1|BE020750
EST:     TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGT                         TATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
genomic: TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGGttcacttgtt ... ttggaacagtTATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
EST: gi|192334402|gb|FK025551.1|FK025551
EST:     TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGT                         TATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
genomic: TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGGttcacttgtt ... ttggaacagtTATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
EST: gi|209718662|gb|BW674764.1|BW674764
EST:     TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTT--AAGT                         TATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
genomic: TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGGttcacttgtt ... ttggaacagtTATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
EST: gi|254347752|gb|GR854001.1|GR854001
EST:     TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGT                         TATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
genomic: TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGGttcacttgtt ... ttggaacagtTATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
EST: gi|192320225|gb|FK014239.1|FK014239
EST:     TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGT                         TATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
genomic: TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGGttcacttgtt ... ttggaacagtTATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
EST: gi|213592918|gb|DB966023.1|DB966023
EST:     TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGT                         TATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
genomic: TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGGttcacttgtt ... ttggaacagtTATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
EST: gi|254324275|gb|GR840592.1|GR840592
EST:     TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGT                         TATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
genomic: TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGGttcacttgtt ... ttggaacagtTATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
EST: gi|308098080|gb|HO761251.1|HO761251
EST:     TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGT                         TATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA
genomic: TTTTGGTATTTGGGATTGATCACCTGGAGTTGGAAATGGTTAAAAGGttcacttgtt ... ttggaacagtTATGGAGTGTTCTGATTTGCAAAAGATATCATGTTGCGGTGCTTAGAGGGA