Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TTTTTGTCCATGAAACTTGCCACCGTGAACCCAGAACTGAACTTTGATGTGGACAGGATCCTATCCAAGGATgtaagtgaagatcttaattctaggtccatttactattattatcacattaaattaagatgatttcatttctcttcaattag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA14G10180.1
intron # 5
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|15285748|gb|BI469639.1|BI469639
EST:     CCGTGAACCCAGAACTGAACTTTGATGTGGACAGGATCCTATCCAAGGAT                         ATTCTCCAATCACGCATAGGACATGGAATTGGTGCATATGGGCCTGGTATC
genomic: CCGTGAACCCAGAACTGAACTTTGATGTGGACAGGATCCTATCCAAGGATgtaagtgaag ... cttcaattagATTCTCCAATCACGCATAGGACATGGAATTGGTGCATATGGTCCTGGTATC
EST: gi|58022718|gb|CX709459.1|CX709459
EST:     ATGTGGACAGGATCCTATCCAAGGAT                         ATTCTCCATTCACGCATAGGACATGGAATTGGTGCATATGGTCCTGGTATC
genomic: ATGTGGACAGGATCCTATCCAAGGATgtaagtgaag ... cttcaattagATTCTCCAATCACGCATAGGACATGGAATTGGTGCATATGGTCCTGGTATC
EST: gi|58014517|gb|CX701259.1|CX701259
EST:     CCGTGAACCCAGAACTGAACTTTGATGTGGACAGGATCCTATCCAAGGAT                         ATTCTCCAATCACGCAT--GACATGGAATTGGTGCATATGGTCCTGGTATC
genomic: CCGTGAACCCAGAACTGAACTTTGATGTGGACAGGATCCTATCCAAGGATgtaagtgaag ... cttcaattagATTCTCCAATCACGCATAGGACATGGAATTGGTGCATATGGTCCTGGTATC
EST: gi|151399817|gb|EV269688.1|EV269688
EST:     CCGTGAACCCAGAACTGAACTTTGATGTGGGCAGGATCCTATCCA-GGAT                         ATTCTCCAATCACGCATAGGACATGGAATTGGTGCATATGGTCCTGGTATC
genomic: CCGTGAACCCAGAACTGAACTTTGATGTGGACAGGATCCTATCCAAGGATgtaagtgaag ... cttcaattagATTCTCCAATCACGCATAGGACATGGAATTGGTGCATATGGTCCTGGTATC
EST: gi|151401288|gb|EV271102.1|EV271102
EST:     CCGTGAACCCAGAACTGAACTTTGATGTGGGCAGGATCCTATCCAAGGAT                         ATTCTCCAATCACGCATAG-ACATGGAATTGGTGCATATGGTCCTGGTATC
genomic: CCGTGAACCCAGAACTGAACTTTGATGTGGACAGGATCCTATCCAAGGATgtaagtgaag ... cttcaattagATTCTCCAATCACGCATAGGACATGGAATTGGTGCATATGGTCCTGGTATC
EST: gi|13252195|gb|BG363098.1|BG363098
EST:     CCGTGAACCCAGAACTGAACTTTGATGTGGACATGATCCTATCCAAGGAT                         ATTCTCCAATCACGCATAGGACATGGAATTGGTGCATATGGTCCTGGTATC
genomic: CCGTGAACCCAGAACTGAACTTTGATGTGGACAGGATCCTATCCAAGGATgtaagtgaag ... cttcaattagATTCTCCAATCACGCATAGGACATGGAATTGGTGCATATGGTCCTGGTATC
EST: gi|254342153|gb|GR853290.1|GR853290
EST:     CCGTGAACCCAGAACTGAACTTTGATGTGGACAGGATCCTATCCAAGGAT                         ATTCTCCAATCACGCATAGGACATGGAATTGGTGCATATGGTCCTGGTATC
genomic: CCGTGAACCCAGAACTGAACTTTGATGTGGACAGGATCCTATCCAAGGATgtaagtgaag ... cttcaattagATTCTCCAATCACGCATAGGACATGGAATTGGTGCATATGGTCCTGGTATC
EST: gi|58018231|gb|CX704973.1|CX704973
EST:     CCGTGAACCCAGAACTGAACTTTGATGTGGACAGGATCCTATCCAAGGAT                         ATTCTCCAATCACGCATAGGACATGGAATTGGTGCATATGGTCCTGGTATC
genomic: CCGTGAACCCAGAACTGAACTTTGATGTGGACAGGATCCTATCCAAGGATgtaagtgaag ... cttcaattagATTCTCCAATCACGCATAGGACATGGAATTGGTGCATATGGTCCTGGTATC