ERISdb: a Database of Plant Splice Sites

General
Orthologs
EST
PPT, BS, UA-tract

Sequence

atgc intronic sequence ATGC exonic sequence

gtaaggctgccagaccttaatttcaatttttgcttcttttttttcttttcttgccgtggttcggttcaatagagtaagttacaagggtttgtttcttgaatgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAGTCCGTCATGCGGGTGACCTGGGAAACATAGTTGCTAATGCAGAGG

Basic information

species	Glycine max
transcript	GLYMA12G08650.1
intron #	3
splice site	3'
intron type	U2

Orthologous splice sites

atgc intronic sequence ATGC exonic sequence

upper sequence: GLYMA12G08650.1 (Glycine max), 3'ss of exon 3
lower sequence: LOC_Os08g44770.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 3

gtaaggctg-ccagaccttaatttcaatttttgcttcttttttttcttttcttgccgtg-gttcggttcaatagagtaagttacaagggtttgtttcttgaatgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAGTCCGTCATGCGGGTGACCTGGGAAACATAGTTGCTAATGCAGAGG
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-taatcctaacccttcattcatttccaaatctcaatcccacctcacatttcccattatccaaacacaccctcacattacatggcaaaactttgt-----------cctgcagGACCACATTTTAACCCAAACAATTTGACGCACGGTGCACCAGAAGATGAAGTCCGTCATGCGGGTGACCTGGGAAACATTGTTGCCAATGCTGAAG

upper sequence: GLYMA12G08650.1 (Glycine max), 3'ss of exon 3
lower sequence: GRMZM2G106928_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 3

gtaaggctgccagaccttaatttcaatttttgcttcttttttttctt--ttcttgccgtggttcggttcaatagagtaagttacaagggtttgtttcttgaatgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAGTCCGTCATGCGGGTGACCTGGGAAACATAGTTGCTAATGCAGAGG
             | ||| | ||    |    ||||| |  |   ||   || |   |  ||||   |    |     |  |  ||    |    | ||  ||  ||| ||||| ||||||||||||| || ||  |||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||
----------tgcatcttcagttatgctcgcccttctataataaattgaatcatctagctgttcaagttgccaagtctaactttaaaaaataaccttttctat--cttacagGACCACATTTTAATCCAAACAATCTGACGCACGGTGCACCAGAAGACGAAGTCCGTCATGCGGGTGACCTGGGAAACATTGTTGCAAATGCTGAGG

upper sequence: GLYMA12G08650.1 (Glycine max), 3'ss of exon 3
lower sequence: Vv06s0061g00750.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3

gtaaggct--gccagaccttaatttcaatttttgcttctttttt-ttcttttcttgccgtggttcggttcaatagagtaagttacaagggtttgtttcttgaat--gactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAGTCCGTCATGCGGGTGACCTGGGAAACATAGTTGCTAATGCAGAGG
||  |  |       |  | || ||  | | ||  || ||  || || |  |  ||   | | |       | | | ||| ||  ||    ||  || |  | |  || |   |||||||||||| ||||| |||    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |
gttggatttgattgtagttcaagtttgactgttaattgttggttattttcctagtgaaattgatgaaaattaaaaactaattttgaatatctttcttttcaattttgaataatagGAGCACATTTCAATCCAAATGGGATGACACATGGTGCTCCTGAAGATGATGTCCGTCATGCGGGTGACCTGGGAAACATAGTTGCCAATGCTGAAG

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments

ATGC    EST sequence
ATGC    genomic sequence (exon)
ATGC    genomic sequence (truncated intron)

EST: gi|208330419|gb|GE129368.1|GE129368

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|208269092|gb|GE068631.1|GE068631

EST:     CCTACATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CCTACATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|208310179|gb|GE109851.1|GE109851

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCGCATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|207776022|gb|GD749889.1|GD749889

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|193543226|gb|FK502923.1|FK502923

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|193498141|gb|FK459133.1|FK459133

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|209704474|gb|BW678417.1|BW678417

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|208075037|gb|GD875534.1|GD875534

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|208162480|gb|GD962287.1|GD962287

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|207750544|gb|GD724385.1|GD724385

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAAT-GGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCCTAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|193526319|gb|FK480709.1|FK480709

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|193395174|gb|FK358633.1|FK358633

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAA
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACA-TTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAA

EST: gi|207751047|gb|GD723054.1|GD723054

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|207757140|gb|GD730098.1|GD730098

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|207774669|gb|GD748033.1|GD748033

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|193370747|gb|FK334145.1|FK334145

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|298186237|gb|HO036870.1|HO036870

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAGTGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAGCTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|207760759|gb|GD734082.1|GD734082

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|298176316|gb|HO023017.1|HO023017

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|207781040|gb|GD753647.1|GD753647

EST:     TGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: TGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|193343451|gb|FK308201.1|FK308201

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|17022579|gb|BM093613.1|BM093613

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|208298679|gb|GE094160.1|GE094160

EST:     TATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: TATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|208175342|gb|GD976415.1|GD976415

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|193661086|gb|FK607430.1|FK607430

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACAAGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|208157958|gb|GD952503.1|GD952503

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCCT-AGGATGAA
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCC-TGAGGATGAA

EST: gi|298199533|gb|HO042896.1|HO042896

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTACTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|193330940|gb|FK297216.1|FK297216

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|208105546|gb|GD904641.1|GD904641

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|193524212|gb|FK480515.1|FK480515

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|208247693|gb|GE045277.1|GE045277

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|208319029|gb|GE112042.1|GE112042

EST:     CTACATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CTACATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|208341891|gb|GE135513.1|GE135513

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|207775534|gb|GD749835.1|GD749835

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAGCTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|193416901|gb|FK383713.1|FK383713

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|193306171|gb|FK272340.1|FK272340

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|193593706|gb|FK547582.1|FK547582

EST:     TGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: TGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|193590862|gb|FK548207.1|FK548207

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|193320177|gb|FK283934.1|FK283934

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|20812682|gb|BQ297160.1|BQ297160

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|193699372|gb|FK639477.1|FK639477

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATCTCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|15338249|gb|BI498905.1|BI498905

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

EST: gi|208194065|gb|GD993830.1|GD993830

EST:     CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAG                         GAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG
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genomic: CATGAGTATGGTGATACCACAAATGGGTGTATATCAACAGgtaaggctgc ... tgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAG

atgc intronic sequence ATGC exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

gtggttcggttcaatagagtaagttacaagggtttgtttcttgaatgactttcagGAGCACATTTTAATCCTAATAACTTGACACATGGTGCTCCTGAGGATGAAGTCCGTCATGCGGGTGACCTGGGAAACATAGTTGCTAATGCAGAGG

                                                ctttc  CT-rich tract
         ttcaata  TA-rich tract

Data associated with selected splice site

Sequence

Basic information

Orthologous splice sites

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments