Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   
2  
 5'  3'   
3  
 5'  3'   
4  
 5'  3'   
5  
 5'  3'   
6  
 5'  3'   
7  
 5'  3'   
8  
 5'  3'   
9  
 5'  3'   
10  
 5'  3'   
11  
 5'  3'   
12  
 5'  3'   
13  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ATTGTTCTGAGGACTTTGAGTACAAAGGAGGACCATTTTCAGCAAGGGATGATTTTTGGGTTGACCTTTTGAAATTCATGTGATGTCGGGGTTACTTAATgtattcccttatgtcccaaaaagcttttccccttcccatccttgttttattttttttcttttggcaattattttcagtattttatatttctgttcactct...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA12G07970.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|24206135|gb|BU965388.1|BU965388
EST:     GATTTTTGGGTTGACCTTTTGAAATTCATGTGATGTCGGGGTTACTTAAT                         TCTTCTCTGAATGGATCTGCTTCAAATCTTCCAGATGGTGCTGGACGGTCT
genomic: GATTTTTGGGTTGACCTTTTGAAATTCATGTGATGTCGGGGTTACTTAATgtattccctt ... ttccttgcagTCTTCTCTGAATGGATCTGCTTCAAATCTTCCAGATGGTGCTGGACGGTCT
EST: gi|213613817|gb|DB961314.1|DB961314
EST:     GATTTTTGGGTTGACCTTTTGAAATTCATGTGATGTCGGGGTTACTTAAT                         TCTTCTCTGAATGGATCTGCTTCAAATCTTCCAGATGGTGCTGGACGGTCT
genomic: GATTTTTGGGTTGACCTTTTGAAATTCATGTGATGTCGGGGTTACTTAATgtattccctt ... ttccttgcagTCTTCTCTGAATGGATCTGCTTCAAATCTTCCAGATGGTGCTGGACGGTCT
EST: gi|208161962|gb|GD962749.1|GD962749
EST:     GATTTTTGGGTTGACCTTTTGAAATTCATGTGATGTCGGGGTTACTTAAT                         TCTTCACTGAATGGATCTGCTTCAAATCTTCCAGATGGTGCTGGACGGTCT
genomic: GATTTTTGGGTTGACCTTTTGAAATTCATGTGATGTCGGGGTTACTTAATgtattccctt ... ttccttgcagTCTTCTCTGAATGGATCTGCTTCAAATCTTCCAGATGGTGCTGGACGGTCT