1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gcaagtcatttgttccctttttcgtttgtattagtcgacgttatttatgttctaccttctttaattattgtacctcttttgtccacaatagATATACCAAGAGGATTTGATGGAGTTGTTGCCCACTGACCAGATATGCAGCGGACATGAAAACATTGATATG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G093096_T02 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATACCTACCTGTTCAGTGAACAAAAGAATGTGAATGCATATGGTGAACAG ATATACCAAGAGGATTTGATGGAGTTGTTGCCCACTGACCAGATATGCAGCEST: gi|67041729|gb|CO467984.1|CO467984
genomic: ATACCTACCTGTTCAGTGAACAAAAGAATGTGAATGCATATGGTGAACAGgcaagtcatt ... tccacaatagATATACCAAGAGGATTTGATGGAGTTGTTGCCCACTGACCAGATATGCAGC
EST: ATACCTACCTGTTCCCCGAACAAAAGAATGTGAATGCATATGGTGAACAG ATATACCAAGAGGATTTGATGGAGTTGTTGCCCACTGACCAGATATGCAGCEST: gi|166477073|gb|EG149180.1|EG149180
genomic: ATACCTACCTGTTCAGTGAACAAAAGAATGTGAATGCATATGGTGAACAGgcaagtcatt ... tccacaatagATATACCAAGAGGATTTGATGGAGTTGTTGCCCACTGACCAGATATGCAGC
EST: ATACCTACCTGTTCAGTGAACAAAAGAATGTGAATGCATATGGTGAACAG ATATACCAAGAGGATTTGATGGAGTTGTTGCCCAEST: gi|67039995|gb|CO466250.1|CO466250
genomic: ATACCTACCTGTTCAGTGAACAAAAGAATGTGAATGCATATGGTGAACAGgcaagtcatt ... tccacaatagATATACCAAGAGGATTTGATGGAGTTGTTGCCCA
EST: ATACCTACCTGTTCAGTGAACCAAAGAATGTGAATGCATATGGGGAACAG ATATACCAAGAGGATTTGATGGAGTTGTTCCCC-CTGACCAGATATGCCGC
genomic: ATACCTACCTGTTCAGTGAACAAAAGAATGTGAATGCATATGGTGAACAGgcaagtcatt ... tccacaatagATATACCAAGAGGATTTGATGGAGTTGTTGCCCACTGACCAGATATGCAGC
gacgttatttatgttctaccttctttaattattgtacctcttttgtccacaatagATATACCAAGAGGATTTGATGGAGTTGTTGCCCACTGACCAGATATGCAGCGGACATGAAAACATTGATATG
ctttaat putative branch site (score: 4)
tacctcttttgtcc putative PPT
ttctttaattattgta TA-rich tract