1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtaagctttgatgcgctttaaaagccaggaaaacatcgagctaaaagtttctaaatggcagCTATCCATCGCTTTGCGGGTCCGAGGTTGCTTGATACTTGCCAGAAGTTGCCCGACGTAGCACCTCAAGGGATCAAGTGCGAGGTCGGTCAGGCTGTGAT
species | Selaginella moellendorffii |
transcript | EFJ23724 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GTGGCTCCTGCGAACAAAAGATGCAATGCCGGATATGGTGTCGATGGAA CTATCCATCGCTTTGCGGGTCCGAGGTTGCTTGATACTTGCCAGAAGTTGCEST: gi|169109370|gb|FE514094.1|FE514094
genomic: GTGGCTCCTGCGAACAAAAGATGCAATGCCGGATATGGTGTCGATGGAAgtaagctttg ... taaatggcagCTATCCATCGCTTTGCGGGTCCGAGGTTGCTTGATACTTGCCAGAAGTTGC
EST: GTGGCTCCTGCGAACAAAAGATGCAATGCCGGATATGGTGTCGATGGAA CTATCCATCGCTTTGCGGGTCCGAGGTTGCTTGATACTTGCCAGAAGTTGCEST: gi|169037545|gb|FE446286.1|FE446286
genomic: GTGGCTCCTGCGAACAAAAGATGCAATGCCGGATATGGTGTCGATGGAAgtaagctttg ... taaatggcagCTATCCATCGCTTTGCGGGTCCGAGGTTGCTTGATACTTGCCAGAAGTTGC
EST: GTGGCTCCTGCGAACAAAAGATGCAATGCCGGATATGGTGTCGATGGAA CTATCCATCGCTTTGCGGGTCCGAGGTTGCTTGATACTTGCCAGAAGTTGCEST: gi|169109371|gb|FE514095.1|FE514095
genomic: GTGGCTCCTGCGAACAAAAGATGCAATGCCGGATATGGTGTCGATGGAAgtaagctttg ... taaatggcagCTATCCATCGCTTTGCGGGTCCGAGGTTGCTTGATACTTGCCAGAAGTTGC
EST: GTGGCTCCTGCGAACAAAAGATGCAATGCCGGATATGGTGTCGATGGAA CTATCCATCGCTTTGCGGGTCCGAGGTTGCTTGATACTTGCCAGAAGTTGC
genomic: GTGGCTCCTGCGAACAAAAGATGCAATGCCGGATATGGTGTCGATGGAAgtaagctttg ... taaatggcagCTATCCATCGCTTTGCGGGTCCGAGGTTGCTTGATACTTGCCAGAAGTTGC
tttgatgcgctttaaaagccaggaaaacatcgagctaaaagtttctaaatggcagCTATCCATCGCTTTGCGGGTCCGAGGTTGCTTGATACTTGCCAGAAGTTGCCCGACGTAGCACCTCAAGGGATCAAGTGCGAGGTCGGTCAGGCTGTGAT
ttctaaa putative branch site (score: 36)
tttct CT-rich tract
taaaagtttctaaat TA-rich tract