1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' |
...aatggacatatatcgattgagtctgaaaaccatgttttatgggcaaaggtgactgcttatgagacgagcatgaatcgaatattcatgaaattttgtgcagGCAGACTTCGTGATCCTCAACCTTGACCTATGGACGATGGTGCCTCTTCTTGACCC
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S61_277V6.2 |
intron # | 8 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AGGCTGTTCTTTGGGAGTCCGAGATTGGGTCCCTTGAAGTCGGGAAGAAG GCAGACTTCGTGATCCTCAACCTTGACCTATGGACGATGGTGCCTCTTCTTEST: gi|208365600|gb|DC944098.1|DC944098
genomic: AGGCTGTTCTTTGGGAGTCCGAGATTGGGTCCCTTGAAGTCGGGAAGAAGgtatttttgt ... ttttgtgcagGCAGACTTCGTGATCCTCAACCTTGACCTATGGACGATGGTGCCTCTTCTT
EST: AGGCTGTTCTTTGGGAGTCCGAGATTGGGTCCCTTGAAGTCGGGAAGAAG GCAGACTTCGTGATCCTCAACCTTGACCTATGGACGATGGTGCCTCTTCTTEST: gi|162176344|gb|FC353529.1|FC353529
genomic: AGGCTGTTCTTTGGGAGTCCGAGATTGGGTCCCTTGAAGTCGGGAAGAAGgtatttttgt ... ttttgtgcagGCAGACTTCGTGATCCTCAACCTTGACCTATGGACGATGGTGCCTCTTCTT
EST: AGGCTGTTCTTTGGGAGTCCGAGATTGGGTCCCTTGAAGTCGGGAAGAAG GCAGACTTCGTGATCCTCAACCTTGACCTATGGACGATGGTGCCTCTTCTTEST: gi|67574672|gb|BJ947496.1|BJ947496
genomic: AGGCTGTTCTTTGGGAGTCCGAGATTGGGTCCCTTGAAGTCGGGAAGAAGgtatttttgt ... ttttgtgcagGCAGACTTCGTGATCCTCAACCTTGACCTATGGACGATGGTGCCTCTTCTT
EST: AGGCTGTTCTTTGGGAGTCCGAGATTGGGTCCCTTGAAGTCGGGAAGAAG GCAGACTTCGTGATCCTCAACCTTGACCTATGGACGATGGTGCCTCTTCTT
genomic: AGGCTGTTCTTTGGGAGTCCGAGATTGGGTCCCTTGAAGTCGGGAAGAAGgtatttttgt ... ttttgtgcagGCAGACTTCGTGATCCTCAACCTTGACCTATGGACGATGGTGCCTCTTCTT
aaggtgactgcttatgagacgagcatgaatcgaatattcatgaaattttgtgcagGCAGACTTCGTGATCCTCAACCTTGACCTATGGACGATGGTGCCTCTTCTTGACCC
aatattcatgaaattt TA-rich tract