1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
AACACACATTAATGTAAGCGAATTTGCAAGAGAGAAAGACTGCCTTGTATGTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaatacactcaataccttgtaactatgttgagaatttctgatgtcatgaacacgtttccttgctagactcactttgctagcttagccacataatc...
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os01g16540.1 |
intron # | 8 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GTGGACCTGGTACCCTTNTTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCNCCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|86499320|gb|CI141953.1|CI141953
genomic: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|88265054|gb|CI368828.1|CI368828
genomic: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: ACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|186893094|gb|FG124779.1|FG124779
genomic: ACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: ACCCTTATTGAACTTGGAACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|186892915|gb|FG124583.1|FG124583
genomic: ACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: ACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|6799264|gb|AU082215.1|AU082215
genomic: ACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|88962036|gb|CI097189.1|CI097189
genomic: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: AACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|88957001|gb|CI095051.1|CI095051
genomic: AACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTTATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|88995589|gb|CI022912.1|CI022912
genomic: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|58596703|gb|CK007231.1|CK007231
genomic: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|186892910|gb|FG124578.1|FG124578
genomic: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: ACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAGGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTGGCEST: gi|86603130|gb|CI357494.1|CI357494
genomic: ACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: T-GAGCCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTT-AAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|86890063|gb|CI320052.1|CI320052
genomic: TGGA-CCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTT-GGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|86852606|gb|CI321726.1|CI321726
genomic: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|86260414|gb|CI066287.1|CI066287
genomic: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACGTCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|88844602|gb|CI020449.1|CI020449
genomic: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|88259418|gb|CI363711.1|CI363711
genomic: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: CTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|88906756|gb|CI375828.1|CI375828
genomic: CTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCGCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|88903448|gb|CI088986.1|CI088986
genomic: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|86490491|gb|CI133124.1|CI133124
genomic: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: CATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|186893091|gb|FG124776.1|FG124776
genomic: CATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: ACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|186892912|gb|FG124580.1|FG124580
genomic: ACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: ACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|88259509|gb|CI363802.1|CI363802
genomic: ACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: TGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|15858734|gb|BI811546.1|BI811546
genomic: TGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|88962230|gb|CI097383.1|CI097383
genomic: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: TGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|86420887|gb|CI056876.1|CI056876
genomic: TGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGAC-TACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|86492554|gb|CI135187.1|CI135187
genomic: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|89173666|gb|CI041559.1|CI041559
genomic: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|86854593|gb|CI258886.1|CI258886
genomic: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|86428975|gb|CI075656.1|CI075656
genomic: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|86825193|gb|CI358315.1|CI358315
genomic: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: CATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|86426268|gb|CI071365.1|CI071365
genomic: CATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|86434920|gb|CI106153.1|CI106153
genomic: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|186892911|gb|FG124579.1|FG124579
genomic: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: ACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|86412974|gb|CI067379.1|CI067379
genomic: ACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|86429309|gb|CI075990.1|CI075990
genomic: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: GGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|186893090|gb|FG124775.1|FG124775
genomic: GGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: TACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|86893103|gb|CI333403.1|CI333403
genomic: TACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGCEST: gi|186893093|gb|FG124778.1|FG124778
genomic: GTGGACCTGGTACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
EST: ACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAG TTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC
genomic: ACCCTTATTGAACTTGGGACATCGACTACCCTCTCAGAGgtcagtaata ... tgataaacagTTCATCAAGATGCTTGAAGAGCACCCCAAGCTGCTAATGTCGAGGGCTAGC