1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
AGGAAATTTCTAATGGAGAAGCACACACCCAAAAGCCTTACAGAATTGAGCTAGTTGGTGTGGTTTGTGATGGCTATCTTGCTGTTGTTAGAGGCATTAGgtatgtatgcttgtggaatcatccatgttactagtctgggaattggttttgttgatatgagtatgactgttaacatgacattggaattttgacag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA20G34750.2 |
intron # | 7 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CTAGTTGGTGTGGTTTGTGATGGCTATCTTGCTGTTGTTAGAGGCATTAG GAGAGCTATTATGACAGGGAGGGCAGTGAGAGTGAATTCACAACTGAAATCEST: gi|209701615|gb|BW660971.1|BW660971
genomic: CTAGTTGGTGTGGTTTGTGATGGCTATCTTGCTGTTGTTAGAGGCATTAGgtatgtatgc ... attttgacagGAGAGCTATTATGACAGGGAGGGCAGTGAGAGTGAATTCACAACTGAAATC
EST: ATGGCTATCTTGCTGTTGTTAGAGGCATTAG GAGAGCTATTATGACAGGGAGGGCAGTGAGAGTGAATTCACAACTGAAATCEST: gi|193491125|gb|FK455564.1|FK455564
genomic: ATGGCTATCTTGCTGTTGTTAGAGGCATTAGgtatgtatgc ... attttgacagGAGAGCTATTATGACAGGGAGGGCAGTGAGAGTGAATTCACAACTGAAATC
EST: CTAGTTGGTGTGGTTTGTGATGGCTATCTTGCTGTTGTTAGAGGCGTTAG GAGAGCTATTATGACAGGGAGGGCAGTGAGAGTGAATTCACAACTGAAATCEST: gi|105633917|gb|DW247280.1|DW247280
genomic: CTAGTTGGTGTGGTTTGTGATGGCTATCTTGCTGTTGTTAGAGGCATTAGgtatgtatgc ... attttgacagGAGAGCTATTATGACAGGGAGGGCAGTGAGAGTGAATTCACAACTGAAATC
EST: CTAGTTGGTGTGGTTTGTGATGGCTATCTTGCTGTTGTTAGAGGCATTAG GAGAGCTGTTATGACAGGGAGGGCAGTGAGAGTGAATTCACAACTGAAATCEST: gi|15337676|gb|BI498332.1|BI498332
genomic: CTAGTTGGTGTGGTTTGTGATGGCTATCTTGCTGTTGTTAGAGGCATTAGgtatgtatgc ... attttgacagGAGAGCTATTATGACAGGGAGGGCAGTGAGAGTGAATTCACAACTGAAATC
EST: CTAGTTGGTGTGGTTTGTGATGGCTATCTTGCTGTTGTTAGAGGCATTAG GAGAGCTATTATGACAGGGAGGGCAGTGAGAGTGAATTCACAACTGAAATCEST: gi|209708386|gb|BW665359.1|BW665359
genomic: CTAGTTGGTGTGGTTTGTGATGGCTATCTTGCTGTTGTTAGAGGCATTAGgtatgtatgc ... attttgacagGAGAGCTATTATGACAGGGAGGGCAGTGAGAGTGAATTCACAACTGAAATC
EST: GTTAGAGGCATTAG GAGAGCTATTATGACAGGGAGGGCAGTGAGAGTGAATTCACAACTGAAATC
genomic: GTTAGAGGCATTAGgtatgtatgc ... attttgacagGAGAGCTATTATGACAGGGAGGGCAGTGAGAGTGAATTCACAACTGAAATC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AGGAAATTTCTAATGGAGAAGCACACACCCAAAAGCCTTACAGAATTGAGCTAGTTGGTGTGGTTTGTGATGGCTATCTTGCTGTTGTTAGAGGCATTAGgtatgtatgcttgtggaatcatccatgttactagtctgggaattggttttgttgatatgagtatgactgttaacatgacattggaattttgacag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGTT