1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
GAATCACAACGTTGAGAACTCACTTAGCTGCTATCAAGAAGCTTTTGATGTTGTTTTTGTGgtaagtggattggatggatggtagaatatgtttagattctttgttcctttagtatgagaacagtcctgttatttttcgcttcaataagtgcctctgcaat...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA20G33690.1 |
intron # | 9 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CTCACTTAGCTGCTATCAAGAAGCTTTTGATGTTGTTTTTGTG AATGATGCACCCATGTGGGGAGTTATCAAACTGGTCTCTCATATGTGTTTAEST: gi|58016010|gb|CX702752.1|CX702752
genomic: CTCACTTAGCTGCTATCAAGAAGCTTTTGATGTTGTTTTTGTGgtaagtggat ... ttacctgcagAATGATGCACCCATGTGGGGAGTTATCAAACTGGTCTCTCATATGTGTTTA
EST: TTGAGAACTCACTTAGCTGCTATCAAGAAGCTTTTGATGTTGTTTTTGTG AATGATGCACCCATGTGGGGAGTTATCAAACTGGTCTCTCATATGTGTTTAEST: gi|58023122|gb|CX709863.1|CX709863
genomic: TTGAGAACTCACTTAGCTGCTATCAAGAAGCTTTTGATGTTGTTTTTGTGgtaagtggat ... ttacctgcagAATGATGCACCCATGTGGGGAGTTATCAAACTGGTCTCTCATATGTGTTTA
EST: TTGAGAACTCACTTAGCTGCTATCAAGAAGCTTTTGATGTTGTTTTTGTG AATGATGCACCCATGTGGGGAGTTATCAAACTGGTCTCTCATATGTGTTTAEST: gi|193371562|gb|FK334947.1|FK334947
genomic: TTGAGAACTCACTTAGCTGCTATCAAGAAGCTTTTGATGTTGTTTTTGTGgtaagtggat ... ttacctgcagAATGATGCACCCATGTGGGGAGTTATCAAACTGGTCTCTCATATGTGTTTA
EST: CTCACTTAGCTTGTCTTATTCAAGAAGCTTTTGATGTTGTTTTTGTG AATGATGCACCCATGTGGGGAGTTATCAAACTGGTCTCTCATATGTGTTTAEST: gi|58024648|gb|CX711389.1|CX711389
genomic: CTCACTTAGC-TG-C-TA-TCAAGAAGCTTTTGATGTTGTTTTTGTGgtaagtggat ... ttacctgcagAATGATGCACCCATGTGGGGAGTTATCAAACTGGTCTCTCATATGTGTTTA
EST: TTGAGAACTCACTTAGCTGCTATCAAGAAGCTTTTGATGTTGTTTTTGTG AATGATGCACCCATGTGGGGAGTTATCAAACTGGTCTCTCATATGTGTTTA
genomic: TTGAGAACTCACTTAGCTGCTATCAAGAAGCTTTTGATGTTGTTTTTGTGgtaagtggat ... ttacctgcagAATGATGCACCCATGTGGGGAGTTATCAAACTGGTCTCTCATATGTGTTTA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GAATCACAACGTTGAGAACTCACTTAGCTGCTATCAAGAAGCTTTTGATGTTGTTTTTGTGgtaagtggattggatggatggtagaatatgtttagattctttgttcctttagtatgagaacagtcctgttatttttcgcttcaataagtgcctctgcaat
- - - - - - - - - - - - AGCTGC
- - - - - - - - - - - - - GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAAGC