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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TCCGGCTCGCATCGAGAAACTCATTGCTGAGAAACAATTTTATGCTGCGGTTCAATTGCATGTGCAATCAATACTGATGCTTGAGCGAGGTCTCCAAACTgtaagatttaacttactatcattatcctattttcagcatgctttgcttagagggcttctatagttctaatttttgtttcttgtatttatgtgttttcgta...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G32370.1
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA20G32370.1 (Glycine max), 5'ss of exon 4
lower sequence: Vv13s0019g04770.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 3
TCCGGCTCGCATCGAGAAACTCATTGCTGAGAAACAATTTTATGCTGCGGTTCAATTGCATGTGCAATCAATACTGATGCTTGAGCGAG---GTCTCCAAACTgtaagatttaacttactatcattatcctattttcagcatgctttgcttagagggcttctatagttctaatttttgtttcttgtatttatgtgttttcgta-------
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---AGCTCGTATTGAGAAGCTCATTGCTGAAAAGCAGTTTTATGCTGCAGTTCAATTGCATGCACAGTCAACATTGATGCTGGAGAGAGAGGGCCTTCAAACGgttagtttt---tta--attttaattttaattttaattttaattaattaattaattaattttattt--attattatcttttgtaataataccacttcattaaaatca