Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTGGCAAGCCCTGGTGGCCTACATCAACATAGGTTGTTATTACTTATTTGGGCTTCCACTGGGGTTCGTTCTTGGTTATACAGCAAATTTGGGGGTTGAGgtaatataccactactatttgtattttctttaaagtctcctttgataaaatttatttagtgaaatctgttgagctttctctatttagatctgcaaaaatt...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G30140.1
intron # 5
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|209702238|gb|BW664247.1|BW664247
EST:     GGCTTCCACTGGGGTTCGTTCTTGGTTATACAGCAAATTTGGGGGTTGAG                         GGACTTTGGGGTGGTATGATATGTGGAATTGTTCTCCAGACCTTGCTGCTC
genomic: GGCTTCCACTGGGGTTCGTTCTTGGTTATACAGCAAATTTGGGGGTTGAGgtaatatacc ... ccccatttagGGACTTTGGGGTGGTATGATATGTGGAATTGTTCTCCAGACCTTGCTGCTC
EST: gi|8286337|gb|BE023896.1|BE023896
EST:     GGCTTCCACTGGGGTTCGTTCTTGGTTATACAGCAAATTTGGGGGTTGAG                         GGACTTTGGGGTGGTATGATATGTGGAATTGTTCTCCANACCTTGCTGCTC
genomic: GGCTTCCACTGGGGTTCGTTCTTGGTTATACAGCAAATTTGGGGGTTGAGgtaatatacc ... ccccatttagGGACTTTGGGGTGGTATGATATGTGGAATTGTTCTCCAGACCTTGCTGCTC
EST: gi|13563321|gb|BG551541.1|BG551541
EST:     GGCTTCCACTGGGGTTCGTTCTTGGTTATACAGCAAATTTGGGGGTTGAG                         GGACTTTGGGGTGGTATGATATGTGGAATTGTTCTCCAGACCTTGCTGCTC
genomic: GGCTTCCACTGGGGTTCGTTCTTGGTTATACAGCAAATTTGGGGGTTGAGgtaatatacc ... ccccatttagGGACTTTGGGGTGGTATGATATGTGGAATTGTTCTCCAGACCTTGCTGCTC
EST: gi|192297109|gb|FG988205.1|FG988205
EST:     GGCTTCCACTGGGGTTCGTTCTTGGTTATACAGCAAATTTGGGGGTTGAG                         GGACTTTGGGGTGGTATGATATGTGGAATTGTTCTCCAGACCTTGCTGCTC
genomic: GGCTTCCACTGGGGTTCGTTCTTGGTTATACAGCAAATTTGGGGGTTGAGgtaatatacc ... ccccatttagGGACTTTGGGGTGGTATGATATGTGGAATTGTTCTCCAGACCTTGCTGCTC
EST: gi|209700017|gb|BW652929.1|BW652929
EST:     GGCTTCCACTGGGGTTCGTTCTTGGTTATACAGCAAATTTGGGGGTTGAG                         GGACTTTGGGGTGGTATGATATGTGGAATTGTTCTCCAGACCTTGCTGCTC
genomic: GGCTTCCACTGGGGTTCGTTCTTGGTTATACAGCAAATTTGGGGGTTGAGgtaatatacc ... ccccatttagGGACTTTGGGGTGGTATGATATGTGGAATTGTTCTCCAGACCTTGCTGCTC
EST: gi|8669788|gb|BE190895.1|BE190895
EST:     GGCTTCCACTGGGGTTCGTTCTTGGTTATACAGCAAATTTGGGGGTTGAG                         GGACTTTGGGGTGGTATGATATGTGGAATTGTTCTCCAGACCTTGCTGCTC
genomic: GGCTTCCACTGGGGTTCGTTCTTGGTTATACAGCAAATTTGGGGGTTGAGgtaatatacc ... ccccatttagGGACTTTGGGGTGGTATGATATGTGGAATTGTTCTCCAGACCTTGCTGCTC