1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gtttgtatttgtaacctttctctagcctttgctatgcttttcataacttcacaacactgacattgcccatattggtgtagGGTCCCTTTGACACCTTTCTAGTTGGTGGTGACACAGCCGAAGTTTGTGATATCAAATTCAGTAATGACGGCAAATCAATGCTTCTGACTACTACTAATA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA19G13070.1 |
intron # | 6 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CAATGGAAGGGGGAGCTATTAAATTATTTGATTCTCGTTCTTATGACAAG GGTCCCTTTGACACCTTTCTAGTTGGTGGTGACACAGCCGAAGTTTGTGATEST: gi|58015238|gb|CX701980.1|CX701980
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EST: CAATGGAAGGGGGAGCTATTAAATTATTTGATTCTCGTTCTTATGACAAG GGTCCCTTTGACACCTTTCTAGTTGGTGGTGACACAGCCGAAGTTTGTGATEST: gi|58016158|gb|CX702900.1|CX702900
genomic: CAATGGAAGGGGGAGCTATTAAATTATTTGATTCTCGTTCTTATGACAAGgtttgtattt ... attggtgtagGGTCCCTTTGACACCTTTCTAGTTGGTGGTGACACAGCCGAAGTTTGTGAT
EST: CAATGGAAGGGGGAGCTATTAAATTATTTGATTCTCGTTCTTATGACAAG GGTCCCTTTGACACCTTTCTAGTTGGTGGTGACACAGCCGAAGTTTGTGATEST: gi|192321957|gb|FK012509.1|FK012509
genomic: CAATGGAAGGGGGAGCTATTAAATTATTTGATTCTCGTTCTTATGACAAGgtttgtattt ... attggtgtagGGTCCCTTTGACACCTTTCTAGTTGGTGGTGACACAGCCGAAGTTTGTGAT
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cctttgctatgcttttcataacttcacaacactgacattgcccatattggtgtagGGTCCCTTTGACACCTTTCTAGTTGGTGGTGACACAGCCGAAGTTTGTGATATCAAATTCAGTAATGACGGCAAATCAATGCTTCTGACTACTACTAATA
cactgac putative branch site (score: 2)
ttttcataa TA-rich tract