1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
...tgcatacttctctaatggataattgcgaggacaaatacagtcagggtggttgtatgctttcgtcttgtactgactttagatgatgcaagtgttgttgcagCTTTGGCAAGTTGAATGATGGCTATGCTTGGAATCCTCATTGTCGATCATACGATGGGATGACACCTACTG
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S99_189V6.2 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTATATGGAGAAAACATTGCTGACAGCTTGAATGGCACAGGGAGAGATAG CTTTGGCAAGTTGAATGATGGCTATGCTTGGGATCCEST: gi|100387720|gb|BY951720.1|BY951720
genomic: TTATATGGAGAAAACATTGCTGACAGCTTGAATGGCACAGGGAGAGATAGgtatgatata ... gttgttgcagCTTTGGCAAGTTGAATGATGGCTATGCTTGGAATCC
EST: TTATATGGAGAAAACATTGCTGACAGCTTGAATGGCACAGGGAGAGATAG CTTTGGCAAGTTGAATGATGGCTATGCTTGGAATCCTCATTGTCGATCATAEST: gi|208347039|gb|DC909337.1|DC909337
genomic: TTATATGGAGAAAACATTGCTGACAGCTTGAATGGCACAGGGAGAGATAGgtatgatata ... gttgttgcagCTTTGGCAAGTTGAATGATGGCTATGCTTGGAATCCTCATTGTCGATCATA
EST: TTATATGGAGAAAACATTGCTGACAGCTTGAATGGCACAGGGAGAGATAG CTTTGGCAAGTTGAATGATGGCTATGCTTGGAATCCTCATTGTCGATCATAEST: gi|208382559|gb|DC923201.1|DC923201
genomic: TTATATGGAGAAAACATTGCTGACAGCTTGAATGGCACAGGGAGAGATAGgtatgatata ... gttgttgcagCTTTGGCAAGTTGAATGATGGCTATGCTTGGAATCCTCATTGTCGATCATA
EST: ATGGCACA-GGAGAGATAG C-TTGGCNAGTTGAATGATGGCTATGCTTGGAATCCTCATTGTCGATCATAEST: gi|100362233|gb|BY947256.1|BY947256
genomic: ATGGCACAGGGAGAGATAGgtatgatata ... gttgttgcagCTTTGGCAAGTTGAATGATGGCTATGCTTGGAATCCTCATTGTCGATCATA
EST: TTATATGGAGAANACATTGCTGACAGCTTGAATGGCACAGGGAGAGATAG CTTTGGCAAGTTGAATGATGGCTATGCTTGGAATCCTCATTGTCGATCATA
genomic: TTATATGGAGAAAACATTGCTGACAGCTTGAATGGCACAGGGAGAGATAGgtatgatata ... gttgttgcagCTTTGGCAAGTTGAATGATGGCTATGCTTGGAATCCTCATTGTCGATCATA
gtggttgtatgctttcgtcttgtactgactttagatgatgcaagtgttgttgcagCTTTGGCAAGTTGAATGATGGCTATGCTTGGAATCCTCATTGTCGATCATACGATGGGATGACACCTACTG
tactgac putative branch site (score: 1)
tttagat TA-rich tract