Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TACTTATGATGATCGCTTGATTGGGAAGATGTAATAGTTTGAAAAGATCGGTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttaggcctcataagcgaaggcattctacaaaatttatcagtagttgcaagctcttagtggcgttgatgtgatggaatgcttgttgtgctttgttt...

Basic information

species Physcomitrella patens
transcript PP1S77_67V6.1
intron # 1
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|100356493|gb|BY946393.1|BY946393
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|208400149|gb|DC904797.1|DC904797
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100441923|gb|BY981146.1|BY981146
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100433601|gb|BY960613.1|BY960613
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|18354198|gb|BJ186254.1|BJ186254
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|208348492|gb|DC913206.1|DC913206
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|67571124|gb|BJ943948.1|BJ943948
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|18352488|gb|BJ184542.1|BJ184542
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100355006|gb|BY964953.1|BY964953
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100383766|gb|BY969295.1|BY969295
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100428521|gb|BY977849.1|BY977849
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|162202569|gb|FC380058.1|FC380058
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100385543|gb|BY969880.1|BY969880
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|22491898|gb|BU051821.1|BU051821
EST:     GGAAACTTGGTAACGGCTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100399802|gb|BY972900.1|BY972900
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|162198705|gb|FC374825.1|FC374825
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100412493|gb|BY974761.1|BY974761
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100368433|gb|BY967008.1|BY967008
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|162211311|gb|FC387541.1|FC387541
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|208371531|gb|DC936252.1|DC936252
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTCCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|208350239|gb|DC901609.1|DC901609
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100397597|gb|BY990306.1|BY990306
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100450777|gb|CJ974434.1|CJ974434
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|208348942|gb|DC913366.1|DC913366
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|22492796|gb|BU052719.1|BU052719
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100387879|gb|BY970624.1|BY970624
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCCTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100418194|gb|BY993379.1|BY993379
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|162222137|gb|FC397365.1|FC397365
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100390343|gb|BY952751.1|BY952751
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|208347143|gb|DC901908.1|DC901908
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|162198662|gb|FC373456.1|FC373456
EST:     TTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: TTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100376489|gb|BY986191.1|BY986191
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100443863|gb|BY982091.1|BY982091
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100406878|gb|BY973912.1|BY973912
EST:     GTAACTTGGGAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|162154996|gb|FC331414.1|FC331414
EST:     TGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: TGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100422641|gb|BY976475.1|BY976475
EST:     AACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: AACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100439008|gb|BY961914.1|BY961914
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100430774|gb|BY978390.1|BY978390
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100354634|gb|BY983488.1|BY983488
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100390415|gb|BY952823.1|BY952823
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|18356788|gb|BJ188847.1|BJ188847
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100389145|gb|BY952349.1|BY952349
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100383456|gb|BY950240.1|BY950240
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100445545|gb|CJ975694.1|CJ975694
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100440750|gb|BY980570.1|BY980570
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100383536|gb|BY950320.1|BY950320
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100398476|gb|BY972627.1|BY972627
EST:     ATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: ATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|162218807|gb|FC394350.1|FC394350
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|18344081|gb|BJ176120.1|BJ176120
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
EST: gi|100381203|gb|BY950023.1|BY950023
EST:     GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGT                         GTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC
genomic: GTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttagg ... catattccagGTGCATCGGTATACGCGGAGCTTTGTCTTCAGTAATTCTATTGATGGCCAC

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
TACTTATGATGATCGCTTGATTGGGAAGATGTAATAGTTTGAAAAGATCGGTAACTTGGAAACTTGGTAACGGTTGCGTGCTTATCTTCTTTCTGGAAGTgtaagttaggcctcataagcgaaggcattctacaaaatttatcagtagttgcaagctcttagtggcgttgatgtgatggaatgcttgttgtgctttgttt

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  TGGAAG