Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...gaaaaactgacagcatttacatatatattaaacatctgttcttagtccttcccctttctttcttttgctaattacacctggggtcacaatgcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGACTCAGGAGCTCAGAGCGGCGATGTCATCATGAGGATGATGGCAAGGAACT

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os06g45820.2
intron # 5
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os06g45820.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: GRMZM2G110408_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 4
gaaaaactgacagcatttacat--atatattaaacatctgttcttagtccttcccctttct---ttcttttgctaattacacctggggtcacaatgcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGACTCAGGAGCTCAGAGCGGCGATGTCATCATGAGGATGATGGCAAGGAACT
      |||  |  ||| |||   || |||  |     |||    || | || |   | ||    |   |||| || |  || || | |||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||    || || ||||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||
----gcctgttataattgacagcaatctatagatttgttgtctcaaggctttactactactgatcttcgttgccaactgtac-tgagatcacaatggtcctgcagATGGTGGTAACGTTCGGTATGTCTGAAATTGGTCCATGGTCTCTGATGGAGGGTGGGGCACAGAGTGGGGACGTCATCATGCGAATGATGGCAAGGAACT

upper sequence: LOC_Os06g45820.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: GRMZM2G087598_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 3
gaaaaactgacagcatttacatatatat-taaacatctgttcttagtccttccccttt-ctttcttttgctaattacacctggggtcacaatgcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGACTCAGGAGCTCAGAGCGGCGATGTCATCATGAGGATGATGGCAAGGAACT
 | |  |||  || ||  |||   || | || | ||||  ||| | | |||  |   | |     ||||  || |  || || | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||
-agagtctgctagaatggacagcgatctgtagatatcttgtctcaatgctttactactaccgatctttgtcaactgtac-tgagatcacaatggttctgcagATGGTTGTGACATTCGGTATGTCTGAAATTGGTCCATGGTCTCTGATGGAGGGTGGAGCGCAGAGTGGGGACGTCATCATGAGAATGATGGCAAGGAACT

upper sequence: LOC_Os06g45820.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: GLYMA08G09160.1 (Glycine max), 3'ss of exon 4
---gaaaaactgacagcattta-catatatattaaacatctgttcttagtccttcccctttctttcttttgctaattacacctggggtcacaatgcttct-gcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGACTCAGGAGCTCAGAGCGGCGATGTCATCATGAGGATGATGGCAAGGAACT
   |||| | ||  |    | |   |  |   | ||| | |  |  |  |              || |||     | |  |||       | ||| |||| ||||||||||   ||||| || ||||| || |||||||| ||||| || |||||  ||  ||| ||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||
attgaaagaatggtaatgatcagtctgaaggatgaacttttaattcttataaaaaaaaaaaaaatcattt-----tcattccttaacctcctatgtttcttgcagATGGTGACCACATTTGGAATGTCTGATATTGGTCCTTGGTCACTTATGGAACCATCAGCACAAGGTGGGGATGTCATCATGAGAATGATGGCAAGGAACT

upper sequence: LOC_Os06g45820.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: GLYMA05G26230.1 (Glycine max), 3'ss of exon 4
gaaaaactgacagcatttacatatatattaaacatctgttcttag----tccttcccctt--tctttcttttgctaattacacctggggtcacaatgcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGACTCAGGAGCTCAGAGCGGCGATGTCATCATGAGGATGATGGCAAGGAACT
  ||   | ||         ||  |  || ||  | | || | |     || ||||  ||   || | |||    ||| |    |      |  || ||  ||||||||||    ||||| || ||||| || |||||||| ||||| || |||||  ||  ||| || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||
-taatgttcactctgaa-ggatgaacttttaatttttcttataaaaaaatctttccatttagcctatgtttcttcaataattgttaa----atgattctcttgcagATGGTAACCACATTTGGAATGTCTGATATTGGTCCTTGGTCACTTATGGAAGCATCAGCACAAAGTGGGGATGTCATCATGAGAATGATGGCAAGGAACT

upper sequence: LOC_Os06g45820.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: AT2G30950.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 4
----gaaaaactgacagcatttacata---tatattaaacatctgttcttagtccttcccctttctttcttttgctaatta-cacctggggtcac--aatgcttct-----gcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGACTCAGGAGCTCAGAGCGGCGATGTCATCATGAGGATGATGGCAAGGAACT---
    |  | ||   |||| || ||||    |||  |  |      |  | |||     |  || ||   |  ||  | | |     || |       |||  || |     |||||||||    ||||| || ||||| || ||||| || |||||  | ||||| ||    || || ||   ||||||||||||||| ||||||||||| ||||   
gtacgcgacacgttcagc-ttcacattagttatgctggagcctgatgataagtttgatcttttactagttgatgaaactgagtgtttgagactgttgaatatttttactttgcagATGGTAACAACATTTGGAATGTCTGATATTGGACCATGGTCTTTGATGGATTCTTCGGCACAAAG---CGATGTCATCATGAGAATGATGGCAAGAAACTCCA

upper sequence: LOC_Os06g45820.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: AT1G06430.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 4
gaaaaactgacagcatttacatatatattaaacatctgttcttagtccttcccctttctttcttttgctaat---tacacctgggg-----tcacaatgcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGACTCAGGAGCTCAGAGCGGCGATGTCATCATGAGGATGATGGCAAGGAACT---
                    || | |  || ||  |     | |||  ||     |  | || |   ||| |   |  || ||        |||  ||     |||||||||||   ||||| || ||||| || || || || |||||||||||||| |||   |  || ||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||   
------------------gtatctcttctacactcccagcttcagtatttttttctgttatcctaaactagtgaatgaacttgacagtatatcatcatttacttgcagATGGTGACAACATTTGGGATGTCTGAAATCGGACCATGGTCGCTAATGGATTCATCGGAGCAAAG---CGATGTCATTATGAGGATGATGGCAAGAAACTCAA

upper sequence: LOC_Os06g45820.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
lower sequence: Vv12s0028g01600.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 4
gaaaaactgacagcatttacatatatattaaacatctgttcttagtccttcccctttctttc------ttttgctaattacacctggggtcacaa-tgcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGACTCAGGAGCTCAGAGCGGCGATGTCATCATGAGGATGATGGCAAGGAACT
      ||  |  | ||||  ||  |  | ||||  |     |   |||  ||  || |||       |||  || | |    | ||  | | || | | | |||||||||||   ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||| |    |||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| |
------cttgct-cttttaactaattgcttaacaaataacaatttccctcacctattatttggacaaatttaactgaatttgacgggtttaataaattcgtttgcagATGGTGACCACATTTGGGATGTCTGACATCGGCCCATGGTCGCTTATGGACACCTCGGCTCAGAGTGCTGATGTCATCATGAGAATGATGGCAAGGAATT

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|163919921|gb|EG710363.1|EG710363
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|88908974|gb|CI716698.1|CI716698
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|29628598|gb|CB633609.1|CB633609
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|89185053|gb|CI049599.1|CI049599
EST:     ATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: ATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|11564899|gb|AU165535.1|AU165535
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|86842811|gb|CI342096.1|CI342096
EST:     AGCTGCTGG-GAC-TGCACCAAA-TACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGG-TACATTCGGTATGTC-GACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: AGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|88673657|gb|CI727770.1|CI727770
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|38480035|gb|CF964124.1|CF964124
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|88595191|gb|CI715347.1|CI715347
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTACCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|38480717|gb|CF964806.1|CF964806
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|89174104|gb|CI041997.1|CI041997
EST:     GCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: GCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|88674852|gb|CI728965.1|CI728965
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|38469160|gb|CF953291.1|CF953291
EST:     GGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: GGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|11442703|gb|BF430606.1|BF430606
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|58590905|gb|CF989213.1|CF989213
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|88844174|gb|CI001231.1|CI001231
EST:     TGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: TGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|29613927|gb|CB618940.1|CB618940
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|88675948|gb|CI730061.1|CI730061
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|58610490|gb|CK038202.1|CK038202
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|88666764|gb|CI718900.1|CI718900
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGANTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCCACCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|88955131|gb|CI721764.1|CI721764
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|86873075|gb|CI328455.1|CI328455
EST:     TGGCNTAGCCAAGCAG                         ATGGT-GTTACATTC-GTATGTCGCACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: TGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|14713849|gb|AU197811.1|AU197811
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTG
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTG
EST: gi|88669667|gb|CI723783.1|CI723783
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|38479234|gb|CF963367.1|CF963367
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|29625516|gb|CB630527.1|CB630527
EST:     CCCCAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|11442742|gb|BF430645.1|BF430645
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|29636881|gb|CB641890.1|CB641890
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|88670905|gb|CI725021.1|CI725021
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|29628517|gb|CB633528.1|CB633528
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|86852819|gb|CI323128.1|CI323128
EST:     GCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAAT-GAC
genomic: GCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|58688946|gb|CK077633.1|CK077633
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|58696098|gb|CK084785.1|CK084785
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|29662978|gb|CB659253.1|CB659253
EST:     CCACAGGAGCTGTTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|4715035|gb|AU056152.1|AU056152
EST:     CCACAGGAGCTNCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAANCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCNTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|22306284|gb|BQ907506.1|BQ907506
EST:     AAATTACTGGCCTAACCCAACCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: AAATTACTGGCCT-AGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|29613925|gb|CB618938.1|CB618938
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|58694217|gb|CK082904.1|CK082904
EST:     CACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|29627170|gb|CB632181.1|CB632181
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|58691649|gb|CK080336.1|CK080336
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|22305353|gb|BQ906575.1|BQ906575
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCNAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|58612372|gb|CK040084.1|CK040084
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|29617927|gb|CB622939.1|CB622939
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|88972393|gb|CI717133.1|CI717133
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|58691399|gb|CK080086.1|CK080086
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|15858429|gb|BI811241.1|BI811241
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|58591390|gb|CF989698.1|CF989698
EST:     CACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         AT-GTGGTGGCATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|86890249|gb|CI321426.1|CI321426
EST:     GTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTC-GACATTGGTCC-TGGTCGCTAATGGAC
genomic: GTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|58695974|gb|CK084661.1|CK084661
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|29613923|gb|CB618936.1|CB618936
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|29687052|gb|CB683327.1|CB683327
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|58688042|gb|CK076729.1|CK076729
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|218484642|gb|FG956651.1|FG956651
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|4716585|gb|AU057701.1|AU057701
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGA-TTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|58612829|gb|CK040541.1|CK040541
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|38472367|gb|CF956498.1|CF956498
EST:     CCAGAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|29658816|gb|CB655091.1|CB655091
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|38480127|gb|CF964216.1|CF964216
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTAGTGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGA
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTA-TGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGA
EST: gi|88974049|gb|CI002711.1|CI002711
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|29673467|gb|CB669742.1|CB669742
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|29673465|gb|CB669740.1|CB669740
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|87008633|gb|CI315091.1|CI315091
EST:     TACT-GCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATTTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: TACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|29622525|gb|CB627536.1|CB627536
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|86889493|gb|CI317293.1|CI317293
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTGGCAGCAAA-TACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGCTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|58691348|gb|CK080035.1|CK080035
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|38480400|gb|CF964489.1|CF964489
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|58690756|gb|CK079443.1|CK079443
EST:     TGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGTTCGCTAATGGAC
genomic: TGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|58692123|gb|CK080810.1|CK080810
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|58692689|gb|CK081376.1|CK081376
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|86876303|gb|CI318352.1|CI318352
EST:     AATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: AATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|88246992|gb|CI246841.1|CI246841
EST:     AGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: AGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|38478771|gb|CF962904.1|CF962904
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|88594935|gb|CI715091.1|CI715091
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|88904735|gb|CI712034.1|CI712034
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|29627091|gb|CB632102.1|CB632102
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|33796340|gb|CF324037.1|CF324037
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCCGTGGTCGCTAATGG
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGG-TGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCC-GTGGTCGCTAATGG
EST: gi|88669535|gb|CI723199.1|CI723199
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAC                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|58693479|gb|CK082166.1|CK082166
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTCCCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
EST: gi|29629665|gb|CB634674.1|CB634674
EST:     CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAG                         ATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC
genomic: CCACAGGAGCTGCTGGTGACTTGCAGCAAATTACTGGCCTAGCCAAGCAGgtacgctata ... gcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGAC


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tccttcccctttctttcttttgctaattacacctggggtcacaatgcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGACTCAGGAGCTCAGAGCGGCGATGTCATCATGAGGATGATGGCAAGGAACT
                    tgctaat  putative branch site (score: 2)
                                            tgcttct  putative PPT
             tttctttt  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
gaaaaactgacagcatttacatatatattaaacatctgttcttagtccttcccctttctttcttttgctaattacacctggggtcacaatgcttctgcagATGGTGGTTACATTCGGTATGTCGGACATTGGTCCGTGGTCGCTAATGGACTCAGGAGCTCAGAGCGGCGATGTCATCATGAGGATGATGGCAAGGAACT

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTCA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGGAA