Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ACTCCTGCACTTGAAGGAATTAAGCTTGTAAAATCAGAGCAAGGAGAAATTTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAAGCATATACTGCCTGTTATAGgtacaagatcatggtccctcaaattgttactgtcgcaagacagtggataaagaaaggcaaatatgttatttgggcctttttcagtgttttttttttcttc...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G34980.1
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|9898873|gb|BE607841.1|BE607841
EST:     TTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAAGCATATACTGCCTGTTATAG                         ACAAGTTTGGAGCTGCTATGGCCCTTGTTAAATCTGACATCGGTGGTAACA
genomic: TTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAAGCATATACTGCCTGTTATAGgtacaagatc ... cttatggcagACAAGTTTGGAGCTGCTATGGCCCTTGTTAAATCTGACATCGGTGGTAACA
EST: gi|58015415|gb|CX702157.1|CX702157
EST:     TTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAATCATATACTGCCTGTTATAG                         ACAAGTTTGGAGCTGCTATGGCCCTTGTTAAATCTGACATCGGTGGTAACA
genomic: TTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAAGCATATACTGCCTGTTATAGgtacaagatc ... cttatggcagACAAGTTTGGAGCTGCTATGGCCCTTGTTAAATCTGACATCGGTGGTAACA
EST: gi|192304253|gb|FG993537.1|FG993537
EST:     TTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAAGCATATACTGCCTGTTATAG                         ACAAGTTTGGAGCTGCTATGGCCCTTGTTAAATCTGACATCGGTGGTAACG
genomic: TTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAAGCATATACTGCCTGTTATAGgtacaagatc ... cttatggcagACAAGTTTGGAGCTGCTATGGCCCTTGTTAAATCTGACATCGGTGGTAACA
EST: gi|58015688|gb|CX702430.1|CX702430
EST:     TTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAATCATATACTGCCTGTTATAG                         ACAAGTTTGGAGCTGCTATGGCCCTTGTTAAATCTGACATCGGTGGTAACA
genomic: TTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAAGCATATACTGCCTGTTATAGgtacaagatc ... cttatggcagACAAGTTTGGAGCTGCTATGGCCCTTGTTAAATCTGACATCGGTGGTAACA
EST: gi|151400774|gb|EV270588.1|EV270588
EST:     TTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAAGCATATACTGCCCGTTATAG                         ACAAGTTTGGAGCTGCTATGGCCCTTGTTAAATCTGACATCGGTGGTAACA
genomic: TTTGACCCAGCCTTTCTTGGATGCTTGCAAGCATATACTGCCTGTTATAGgtacaagatc ... cttatggcagACAAGTTTGGAGCTGCTATGGCCCTTGTTAAATCTGACATCGGTGGTAACA