Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TCAAGACTTTTCACAAGGAATGGAGTTGATAGGAGCAAGAACAAGGATGTAACGACAAAATGCCTTCAATGTCGTGGGGAAGGTCGCTTGCTGTGTACAGgtatgcaatttatctgttgtatttcaatgaaactgtcattatttgctagtatgttcattgatcattgttctggaagacaaacctcacagtaaattcactt...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G34000.1
intron # 5
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|209711423|gb|BW665175.1|BW665175
EST:     AACGACAAAATGCCTTCAATGTCGTGGGGAAGGTCGCTTGCTGTGTACAG                         TTTTTGGAATGGGTGGACGAGGGTACAAAATGCCCATATTGTGAAGGCCTA
genomic: AACGACAAAATGCCTTCAATGTCGTGGGGAAGGTCGCTTGCTGTGTACAGgtatgcaatt ... tttaatgcagTTTTTGGAATGGGTGGACGAGGGTACAAAATGCCCATATTGTGAAGGCCTA
EST: gi|209714158|gb|BW679487.1|BW679487
EST:     AACGACAAAATGCCTTCAATGTCGTGGGGAAGGTCGCTTGCTGTGTACAG                         TTTTTGGAATGGGTGGACGAGGGTACAAAATGCCCATATTGTGAAGGCCTA
genomic: AACGACAAAATGCCTTCAATGTCGTGGGGAAGGTCGCTTGCTGTGTACAGgtatgcaatt ... tttaatgcagTTTTTGGAATGGGTGGACGAGGGTACAAAATGCCCATATTGTGAAGGCCTA
EST: gi|209711424|gb|BW665176.1|BW665176
EST:     AACGACAAAATGCCTTCAATGTCGTGGGGAAGGTCGCTTGCTGTGTACAG                         TTTTTGGAATGGGTGGACGAGGGTACAAAATGCCCATATTGTGAAGGCCTA
genomic: AACGACAAAATGCCTTCAATGTCGTGGGGAAGGTCGCTTGCTGTGTACAGgtatgcaatt ... tttaatgcagTTTTTGGAATGGGTGGACGAGGGTACAAAATGCCCATATTGTGAAGGCCTA