1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
GGTTTCATGGTTGTTGAGCGTGCATCAGTGTATGGTTCCAGGAATATGCTTGATCAGCACCGAGACATGAGGATGGATGTAGATAACATGAGTTATGAGgtgattattaatttaccactgtttctagtgttgcaattaatattatcattattatgtactaagattttttaattattttgatgactggtttgaccag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA19G36400.2 |
intron # | 6 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: ATCAGACA-CGAGACATGAGGATGGATGTAGATAGA-AGGAGTTTA-GAG GAACTACTTGCACTTGGTGAGAGGACTT-GCTATGTGAACACAGGAGTCTEST: gi|16106275|gb|BI894015.1|BI894015
genomic: ATCAG-CACCGAGACATGAGGATGGATGTAGATA-ACATGAG-TTATGAGgtgattatta ... gtttgaccagGAACTACTTGCACTTGGTGAGAGGA-TTGGCTATGTGAACACAGGAGTCT
EST: TTGATCAGCACCGAGACATGAGGATGGATGTAGATAACATGAGTTATGAG GAACTACTTGCACTTGGTGAGAGGATTGGCTATGTGAACACAGGAGTCTCTEST: gi|27427324|gb|CA938844.1|CA938844
genomic: TTGATCAGCACCGAGACATGAGGATGGATGTAGATAACATGAGTTATGAGgtgattatta ... gtttgaccagGAACTACTTGCACTTGGTGAGAGGATTGGCTATGTGAACACAGGAGTCTCT
EST: TTGATCAGCACCGAGACATGAGGATGGATGTAGATAACATGAGTTATGAG GAACTACTTGCACTTGGTGAGAGGATTGGCTATGTGAACACAGGAGTCTCTEST: gi|10253219|gb|BE820985.1|BE820985
genomic: TTGATCAGCACCGAGACATGAGGATGGATGTAGATAACATGAGTTATGAGgtgattatta ... gtttgaccagGAACTACTTGCACTTGGTGAGAGGATTGGCTATGTGAACACAGGAGTCTCT
EST: TTGATCAGCACCGAGACATGAGGATGGATGTAGATAACATGAGTTATGAG GAACTACTTGCACTTGGTGAGAGGATTGGCTATGTGAACACAGGAGTCTCTEST: gi|209725622|gb|BW663111.1|BW663111
genomic: TTGATCAGCACCGAGACATGAGGATGGATGTAGATAACATGAGTTATGAGgtgattatta ... gtttgaccagGAACTACTTGCACTTGGTGAGAGGATTGGCTATGTGAACACAGGAGTCTCT
EST: TTGATCAGCACCGAGACATGAGGATGGATGTAGATAACATGAGTTATGAG GAACTACTTGCACTTGGTGAGAGGATTGGCTATGTGAACACAGGAGTCTCT
genomic: TTGATCAGCACCGAGACATGAGGATGGATGTAGATAACATGAGTTATGAGgtgattatta ... gtttgaccagGAACTACTTGCACTTGGTGAGAGGATTGGCTATGTGAACACAGGAGTCTCT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GGTTTCATGGTTGTTGAGCGTGCATCAGTGTATGGTTCCAGGAATATGCTTGATCAGCACCGAGACATGAGGATGGATGTAGATAACATGAGTTATGAGgtgattattaatttaccactgtttctagtgttgcaattaatattatcattattatgtactaagattttttaattattttgatgactggtttgaccag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GATGGA