1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
TCTAGCATGGCGGATCTTTCTGGTCAGACTTCTGGTACATTAACAAGGGATTGGAGCCAAATGAACATGTCTCCAGCTAATGGAAGGGTGTTATTATCAGgttagtttgctgctcataaatgttagtatcaatacatacacattccattctctttgcctttatatctaaaaaatctgacttaaaatgcag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA19G36400.2 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TTGGAGCCAAATGAACATGTCTCCAGCTAATGGAAGGGTGTTATTATCAG ATACAAGTTCTTTTGGTCTTGAAACAAGTCACTTCCTTGTTGGAAGTGGTGEST: gi|19934593|gb|BQ079623.1|BQ079623
genomic: TTGGAGCCAAATGAACATGTCTCCAGCTAATGGAAGGGTGTTATTATCAGgttagtttgc ... taaaatgcagATACAAGTTCTTTTGGTCTTGAAACAAGTCACTTCCTTGTTGGAAGTGGTG
EST: TTGGAGCCAAATGAACATGTCTCCAGCTAATGGAAGGGTGTTATTATCAG ATACAAGTTCTTTTGGTCTTGAAACAAGTCACTTCCTTGTTGGAAGTGGTGEST: gi|7028117|gb|AW457900.1|AW457900
genomic: TTGGAGCCAAATGAACATGTCTCCAGCTAATGGAAGGGTGTTATTATCAGgttagtttgc ... taaaatgcagATACAAGTTCTTTTGGTCTTGAAACAAGTCACTTCCTTGTTGGAAGTGGTG
EST: TTGGAGCCAAATGAACATGTCTCCAGCTAATGGAAGGGTGTTATTATCAG ATACAAGTTCTTTTGGTCTTGAAACAAGTCACTTCCTTGTTGGAAGTGGTGEST: gi|254337202|gb|GR849262.1|GR849262
genomic: TTGGAGCCAAATGAACATGTCTCCAGCTAATGGAAGGGTGTTATTATCAGgttagtttgc ... taaaatgcagATACAAGTTCTTTTGGTCTTGAAACAAGTCACTTCCTTGTTGGAAGTGGTG
EST: TTGGAGCCAAATGAACATGTCTCCAGCTAATGGAAGGGTGTTATTATCAG ATACAAGTTCTTTTGGTCTTGAAACAAGTCACTTCCTTGTTGGAAGTGGTGEST: gi|254338521|gb|GR849939.1|GR849939
genomic: TTGGAGCCAAATGAACATGTCTCCAGCTAATGGAAGGGTGTTATTATCAGgttagtttgc ... taaaatgcagATACAAGTTCTTTTGGTCTTGAAACAAGTCACTTCCTTGTTGGAAGTGGTG
EST: TTGGAGCCAAATGAACATGTCTCCAGCTAATGGAAGGGTGTTATTATCAG ATACAAGTTCTTTTGGTCTTGAAACAAGTCACTTCCTTGTTGGAAGTGGTG
genomic: TTGGAGCCAAATGAACATGTCTCCAGCTAATGGAAGGGTGTTATTATCAGgttagtttgc ... taaaatgcagATACAAGTTCTTTTGGTCTTGAAACAAGTCACTTCCTTGTTGGAAGTGGTG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TCTAGCATGGCGGATCTTTCTGGTCAGACTTCTGGTACATTAACAAGGGATTGGAGCCAAATGAACATGTCTCCAGCTAATGGAAGGGTGTTATTATCAGgttagtttgctgctcataaatgttagtatcaatacatacacattccattctctttgcctttatatctaaaaaatctgacttaaaatgcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAAG