Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTGTTGGCCTTGTTTGTGTTTTCGACAATTGGAAGATATAGTCATGGACTTTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGGgtgtgtttggttttatgttttgctcttttttgtttttgttcatgattgtgttggatttgtgttttggagagtttgaggtttgaaaattgagtgtgtttttcaatggtgtgcag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA17G35070.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|192313154|gb|FK004716.1|FK004716
EST:     TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGG                         GGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGCG
genomic: TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGGgtgtgtttgg ... tggtgtgcagGGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGCG
EST: gi|151395440|gb|EV265317.1|EV265317
EST:     TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGG                         GGTGGTTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGC
genomic: TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGGgtgtgtttgg ... tggtgtgcagGGTGGTTTTT-GGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGC
EST: gi|151404541|gb|EV274355.1|EV274355
EST:     TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGG                         GGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGCG
genomic: TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGGgtgtgtttgg ... tggtgtgcagGGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGCG
EST: gi|192315385|gb|FK007759.1|FK007759
EST:     TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGG                         GGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGCG
genomic: TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGGgtgtgtttgg ... tggtgtgcagGGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGCG
EST: gi|10844188|gb|BF067515.1|BF067515
EST:     TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTGTTATTGCGC                         GGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTT
genomic: TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGGgtgtgtttgg ... tggtgtgcagGGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTT
EST: gi|192315386|gb|FK007760.1|FK007760
EST:     TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGG                         GGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGCG
genomic: TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGGgtgtgtttgg ... tggtgtgcagGGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGCG
EST: gi|213614162|gb|DB964906.1|DB964906
EST:     TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGG                         GGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGCG
genomic: TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGGgtgtgtttgg ... tggtgtgcagGGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGCG
EST: gi|209704322|gb|BW683554.1|BW683554
EST:     TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGG                         GGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGCG
genomic: TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGGgtgtgtttgg ... tggtgtgcagGGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGCG
EST: gi|192320999|gb|FK013501.1|FK013501
EST:     TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGG                         GGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGCG
genomic: TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGGgtgtgtttgg ... tggtgtgcagGGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGCG
EST: gi|192313155|gb|FK004717.1|FK004717
EST:     TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGG                         GGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGCG
genomic: TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGGgtgtgtttgg ... tggtgtgcagGGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGCG
EST: gi|209699754|gb|BW655780.1|BW655780
EST:     TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGG                         GGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGCG
genomic: TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGGgtgtgtttgg ... tggtgtgcagGGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGCG
EST: gi|192320998|gb|FK013500.1|FK013500
EST:     TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGG                         GGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGCG
genomic: TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGGgtgtgtttgg ... tggtgtgcagGGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGCG
EST: gi|209699755|gb|BW655781.1|BW655781
EST:     TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGG                         GGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGCG
genomic: TTCTGTTTTGGACCTTGAGACACTGCGCACTGCTGACCCTTTTATTGCGGgtgtgtttgg ... tggtgtgcagGGTGGTTTTTGGGTGCTTACTTCCTTGGAGGTTTTGGGGAGGATGGCCGCG