Mapped EST sequences
Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments
ATGC EST sequence
ATGC genomic sequence (exon)
ATGC genomic sequence (truncated intron)
EST:
gi|209717809|gb|BW668946.1|BW668946EST: GACCCTATTGCAGTTAACCCCTGCGTTTGTCCTACTTGCGAAGGTAACAG AGTTCAACGCTGTTTGAACTGTCTTGGAAAAGGCTATGATTGACCTATTAT
genomic: GACCCTATTGCAGTTAACCCCTGCGTTTGTCCTACTTGCGAAGGTAACAGgttaggctcc ... ggttgtgcagAGTTCAACGCTGTTTGAACTGTCTTGGAAAAGGCTATGATTGACCTATTAT
EST:
gi|209717808|gb|BW668945.1|BW668945EST: GACCCTATTGCAGTTAACCCCTGCGTTTGTCCTACTTGCGAAGGTAACAG AGTTCAACGCTGTTTGAACTGTCTTGGAAAAGGCTATGATTGACCTATTAT
genomic: GACCCTATTGCAGTTAACCCCTGCGTTTGTCCTACTTGCGAAGGTAACAGgttaggctcc ... ggttgtgcagAGTTCAACGCTGTTTGAACTGTCTTGGAAAAGGCTATGATTGACCTATTAT
EST:
gi|31561872|gb|CD487710.1|CD487710EST: GACCCTATTGCAGTTAACCCCTGCGTTTGTCCTACTTGCGAAGGTAACAG AGTTCAACGCTGTTTGAACTGTCTTGGAAAAGGCTATGATTGACCTATTAT
genomic: GACCCTATTGCAGTTAACCCCTGCGTTTGTCCTACTTGCGAAGGTAACAGgttaggctcc ... ggttgtgcagAGTTCAACGCTGTTTGAACTGTCTTGGAAAAGGCTATGATTGACCTATTAT
EST:
gi|58024486|gb|CX711227.1|CX711227EST: GACCCTATTGCAGTTAACCCCTGCGTTTGTCCTACTTGCGAAGGTAACAG AGTTCAACGCTGTTTGAACTGTCTTGGAAAAGGCTATGATTGACCTATTAT
genomic: GACCCTATTGCAGTTAACCCCTGCGTTTGTCCTACTTGCGAAGGTAACAGgttaggctcc ... ggttgtgcagAGTTCAACGCTGTTTGAACTGTCTTGGAAAAGGCTATGATTGACCTATTAT
EST:
gi|193319771|gb|FK285194.1|FK285194EST: GACCCTATTGCAGTTAACCCCTGCGTTTGTCCTACTTGCGAAGGTAACAG AGTTCAACGCTGTT
genomic: GACCCTATTGCAGTTAACCCCTGCGTTTGTCCTACTTGCGAAGGTAACAGgttaggctcc ... ggttgtgcagAGTTCAACGCTGTT
EST:
gi|298172604|gb|HO019644.1|HO019644EST: GACCCTATTGCAGTTAACCCCTGCGTTTGTCCTACTTGCGAAGGTAACAG AGTTCAACGCTGTTTGAACTGTCTTGGAAAAGGCTATGATTGACCTATTAT
genomic: GACCCTATTGCAGTTAACCCCTGCGTTTGTCCTACTTGCGAAGGTAACAGgttaggctcc ... ggttgtgcagAGTTCAACGCTGTTTGAACTGTCTTGGAAAAGGCTATGATTGACCTATTAT
EST:
gi|193336802|gb|FK304540.1|FK304540EST: GACCCTATTGCAGTTAACCCCTGCGTTTGTCCTACTTGCGAAGGTAACAG AGTTCAACGCTGTTTGAACTGTCTTGGAAAAGGCTATGATTGACCTATTAT
genomic: GACCCTATTGCAGTTAACCCCTGCGTTTGTCCTACTTGCGAAGGTAACAGgttaggctcc ... ggttgtgcagAGTTCAACGCTGTTTGAACTGTCTTGGAAAAGGCTATGATTGACCTATTAT
atgc intronic sequence ATGC exonic sequenceIntronic sequence truncated to 55 bases.cattatgactattttgggctatgaaattttctaacacatactcttggttgtgcagAGTTCAACGCTGTTTGAACTGTCTTGGAAAAGGCTATGATTGACCTATTATGGGATATTGAGATGGACACTGCTGCATTTGTTTTGTTCATTTAGAATCT
ttctaac putative branch site (score: 1)
tatgaaattttctaa TA-rich tract