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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TGAATCTGTGGAAAAATCTAGGATATGGAAGCTGACAGAAATTAATGAACCATCACAATGCCGCTCCCTGAAACTTCCTGATAGTTTATCATCTATGAGGgtactgcagatattaaaatcttatatattcataatatttttttggcatgtgaagctgatgcctgtacttgtattctattcccatcaatgcatccatgctt...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA17G12110.2
intron # 19
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA17G12110.1 (Glycine max), 5'ss of exon 19
lower sequence: Vv11s0016g05620.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 19
TGAATCTGTGGAAAAATCTAGGATATGGAAGCTGACAGAAATTAATGAACCATCACAATGCCGCTCCCTGAAACTTCCTGATAGTTTATCATCTATGAGGgtactgcagatattaaaatcttatata-ttcataatatttttttggcatgtgaagctgatgcctgtacttgtattctattcccatcaatgcatccatgctt---
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TGAGTCAGGAGAAAAATCTAGGATCTGGAAACTTACAGAAATCAATGAACAATCACAATGTCGCTCCTTGAGGCTTCCTGATAACTTAACGGCTATGAGGgtaaag-attgacttcattcaaacttaatttttggttttttatttgcccct---ttttagggctttcctcactttcctggacctgcatatgattcttggttctt