Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GATTGACCTCTGTTGATGTTGATGATGCTTTTGATTCGGCTTCTCAAGTGAATGTCCATGGgtatgtatgttcactttgaattgttttatccttgcttattatgaatccttttttgaatttctttttgaatgtggaatgaacag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA16G21560.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|192297628|gb|FG989921.1|FG989921
EST:     GTTGATGTTGATGATGCTTTTGATTCGGCTTCTCGAGTGAATGTCCATGG                         GTGGACTATCAACAATAAGTACTACACTGCTGATGTTTCTCTTTGGATGGC
genomic: GTTGATGTTGATGATGCTTTTGATTCGGCTTCTCAAGTGAATGTCCATGGgtatgtatgt ... gaatgaacagGTGGACTATCAACAATAAGTACTACACTGCTGATGTTTCTCTTTGGATGGC
EST: gi|192333176|gb|FK026505.1|FK026505
EST:     GTTGATGTTGATGATGCTTTTGATTCGGCTTCTCAAGTGAATGTCCATGG                         GTGGACTATCAACAATAAGTACTACACTGCTGATGTTTCTCTTTGGATGGC
genomic: GTTGATGTTGATGATGCTTTTGATTCGGCTTCTCAAGTGAATGTCCATGGgtatgtatgt ... gaatgaacagGTGGACTATCAACAATAAGTACTACACTGCTGATGTTTCTCTTTGGATGGC
EST: gi|151405714|gb|EV275528.1|EV275528
EST:     GTTGATGTTGATGATGCTTTTGATTCGGCTTCTCAAGTGAATGTCCATGG                         GTGGACTATCAACAATAAGTACTACACTGCTGATGTTTCTCTTTGGATGGC
genomic: GTTGATGTTGATGATGCTTTTGATTCGGCTTCTCAAGTGAATGTCCATGGgtatgtatgt ... gaatgaacagGTGGACTATCAACAATAAGTACTACACTGCTGATGTTTCTCTTTGGATGGC
EST: gi|298189562|gb|HO037965.1|HO037965
EST:     GTTGATGTTGATGATGCTTTTGATTCGGCTTCTCAAGTGAATGTCCACGG                         GTGGACTATCAACAATAAGTACTACACTGCTGATGTTTCTCTTTGGATGGC
genomic: GTTGATGTTGATGATGCTTTTGATTCGGCTTCTCAAGTGAATGTCCATGGgtatgtatgt ... gaatgaacagGTGGACTATCAACAATAAGTACTACACTGCTGATGTTTCTCTTTGGATGGC
EST: gi|151409293|gb|EV279101.1|EV279101
EST:     GTTGATGTTGATGATGCTTTTGATTCGGCTTCTCAAGTGAATGTCCATGG                         GTGGACTATCAACAATAAGTACTACACTGCTGATGTTTCTCTTTGGATGGC
genomic: GTTGATGTTGATGATGCTTTTGATTCGGCTTCTCAAGTGAATGTCCATGGgtatgtatgt ... gaatgaacagGTGGACTATCAACAATAAGTACTACACTGCTGATGTTTCTCTTTGGATGGC
EST: gi|209728151|gb|BW655386.1|BW655386
EST:     GTTGATGTTGATGATGCTTTTGATTCGGCTTCTCAAGTGAATGTCCATGG                         GTGGACTATCAACAATAAGTACTACACTGCTGATGTTTCTCTTTGGATGGC
genomic: GTTGATGTTGATGATGCTTTTGATTCGGCTTCTCAAGTGAATGTCCATGGgtatgtatgt ... gaatgaacagGTGGACTATCAACAATAAGTACTACACTGCTGATGTTTCTCTTTGGATGGC