1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
...actattgtctcttgggaaaatatccaataaccaatttgtcttcaattttgaagaaatgctcatcatttgctttaatagtatggtgttgttgtctttgcagGAATGTGTGAATCCTTTTGATTATTGTGACATTGTTACTTCAACAACTCACAAGAGTCTTCGAGGTCCAAGGGGAGGCATAATTTTTTATCGGAAAGGTA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA08G20050.3 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTGTGTTGTTGTGTGACATGGCGCAGATTAGTGGCATAATTGCAGCCAAG GAATGTGTGAATCCTTTTGATTATTGTGACATTGTTACTTCAACAACTCACEST: gi|213593771|gb|DB957891.1|DB957891
genomic: CTGTGTTGTTGTGTGACATGGCGCAGATTAGTGGCATAATTGCAGCCAAGgtgtgaaata ... gtctttgcagGAATGTGTGAATCCTTTTGATTATTGTGACATTGTTACTTCAACAACTCAC
EST: CTGTGTTGTTGTGTGACATGGCGCAGATTAGTGGCATAATTGCAGCCAAG GAATGTGTGAATCCTTTTGATTATTGTGACATTGTTACTTCAACAACTCACEST: gi|7588515|gb|AW704239.1|AW704239
genomic: CTGTGTTGTTGTGTGACATGGCGCAGATTAGTGGCATAATTGCAGCCAAGgtgtgaaata ... gtctttgcagGAATGTGTGAATCCTTTTGATTATTGTGACATTGTTACTTCAACAACTCAC
EST: GGCATAATTGCAGCCAAG GAATGTGTGAATCCTTTTGATTATTGTGACATTGTTACTTCAACAACTCACEST: gi|22539881|gb|BU089724.1|BU089724
genomic: GGCATAATTGCAGCCAAGgtgtgaaata ... gtctttgcagGAATGTGTGAATCCTTTTGATTATTGTGACATTGTTACTTCAACAACTCAC
EST: CTGTGTTGTTGTGTGACATGGCGCAGATTAGTGGCATAATTGCAGCCAAG GAATGTGTGAATCCTTTTGATTATTGTGACATTGTTACTTCAACAACTCAC
genomic: CTGTGTTGTTGTGTGACATGGCGCAGATTAGTGGCATAATTGCAGCCAAGgtgtgaaata ... gtctttgcagGAATGTGTGAATCCTTTTGATTATTGTGACATTGTTACTTCAACAACTCAC
ttttgaagaaatgctcatcatttgctttaatagtatggtgttgttgtctttgcagGAATGTGTGAATCCTTTTGATTATTGTGACATTGTTACTTCAACAACTCACAAGAGTCTTCGAGGTCCAAGGGGAGGCATAATTTTTTATCGGAAAGGTA
ctttaat putative branch site (score: 4)
ttgtcttt putative PPT
tttaatagtat TA-rich tract