1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
GCTTTACTCGTATATATTTGATATTGATGTGGGTTCTGGATCAGCCGCAACGGCAGATAAACCTATACCAAGTGCCATATTTGTAGTGAATTTTGATAAGgtatggcttccagtgctcttcttacttcttgaatcttgcatatggtatgcagattgtccaaatgctttatctgttcttgtattttttttgctttgttttg...
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT4G16180.1 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CGGCAGATAAACCTATACCAAGTGCCATATTTGTAGTGAATTTTGATAAG GTAAGAATGGATCCTAAAAATACAGAGATTGATCTAGACAGCTTGATGTTTEST: gi|116426964|gb|EG469556.1|EG469556
genomic: CGGCAGATAAACCTATACCAAGTGCCATATTTGTAGTGAATTTTGATAAGgtatggcttc ... cattattcagGTAAGAATGGATCCTAAAAATACAGAGATTGATCTAGACAGCTTGATGTTT
EST: CGGCAGATAAACCTATACCAAGTGCCATATTTGTAGTGAATTTTGATAAG GTAAGAATGGATCCTAAAAATACAGAGATTGATCTAGACAGCTTGATGTTTEST: gi|116426974|gb|EG469566.1|EG469566
genomic: CGGCAGATAAACCTATACCAAGTGCCATATTTGTAGTGAATTTTGATAAGgtatggcttc ... cattattcagGTAAGAATGGATCCTAAAAATACAGAGATTGATCTAGACAGCTTGATGTTT
EST: CGGCAGATAAACCTATACCAAGTGCCATATTTGTAGTGAATTTTGATAAG GTAAGAATGGATCCTAAAAATACAGAGATTGATCTAGACAGCTTGATGTTTEST: gi|116426972|gb|EG469564.1|EG469564
genomic: CGGCAGATAAACCTATACCAAGTGCCATATTTGTAGTGAATTTTGATAAGgtatggcttc ... cattattcagGTAAGAATGGATCCTAAAAATACAGAGATTGATCTAGACAGCTTGATGTTT
EST: CGGCAGATAAACCTATACCAAGTGCCATATTTGTAGTGAATTTTGATAAG GTAAGAATGGATCCTAAAAATACAGAGATTGATCTAGACAGCTTGATGTTTEST: gi|116426965|gb|EG469557.1|EG469557
genomic: CGGCAGATAAACCTATACCAAGTGCCATATTTGTAGTGAATTTTGATAAGgtatggcttc ... cattattcagGTAAGAATGGATCCTAAAAATACAGAGATTGATCTAGACAGCTTGATGTTT
EST: CGGCAGATAAACCTATACCAAGTGCCATATTTGTAGTGAATTTTGATAAG GTAAGAATGGATCCTAAAAATACAGAGATTGATCTAGACAGCTTGATGTTT
genomic: CGGCAGATAAACCTATACCAAGTGCCATATTTGTAGTGAATTTTGATAAGgtatggcttc ... cattattcagGTAAGAATGGATCCTAAAAATACAGAGATTGATCTAGACAGCTTGATGTTT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GCTTTACTCGTATATATTTGATATTGATGTGGGTTCTGGATCAGCCGCAACGGCAGATAAACCTATACCAAGTGCCATATTTGTAGTGAATTTTGATAAGgtatggcttccagtgctcttcttacttcttgaatcttgcatatggtatgcagattgtccaaatgctttatctgttcttgtattttttttgctttgttttg
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