1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
GTGCTTCTTGGCTTCTCTATCCTTGTTGGTGCCAGTGCTTGGGTGGATCTTTTGgtatatactcagattatcccaaaaaatttcttctccagtctcttttgatcttttgtcacccaagttaacttcagtctgatcaaaacatttcag
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT4G04860.1 |
intron # | 5 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CCTTGTTGGTGCCAGTGCTTGGGTGGATCTTTTG GGTATGATAGCAGGTCACGCTTACTACTTTCTGGCTGAGGTTTATCCGCGAEST: gi|125292653|gb|EL306738.1|EL306738
genomic: CCTTGTTGGTGCCAGTGCTTGGGTGGATCTTTTGgtatatactc ... aacatttcagGGTATGATAGCAGGTCACGCTTACTACTTTCTGGCTGAGGTTTATCCGCGA
EST: TTGGTGCCAGTGCTTGGGTGGATCTTTTG GGTATGATAGCAGGTCACGCTTACTACTTTCTGGCTGAGGTTTATCCGCGAEST: gi|124814233|gb|EH899099.1|EH899099
genomic: TTGGTGCCAGTGCTTGGGTGGATCTTTTGgtatatactc ... aacatttcagGGTATGATAGCAGGTCACGCTTACTACTTTCTGGCTGAGGTTTATCCGCGA
EST: TGCCAGTGCTTGGGTGGATCTTTTG GGTATGATAGCAGGTCACGCTTACTACTTTCTGGCTGAGGTTTATCCGCCA
genomic: TGCCAGTGCTTGGGTGGATCTTTTGgtatatactc ... aacatttcagGGTATGATAGCAGGTCACGCTTACTACTTTCTGGCTGAGGTTTATCCGCGA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GTGCTTCTTGGCTTCTCTATCCTTGTTGGTGCCAGTGCTTGGGTGGATCTTTTGgtatatactcagattatcccaaaaaatttcttctccagtctcttttgatcttttgtcacccaagttaacttcagtctgatcaaaacatttcag
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